The prosecution's case was made more difficult after a ruling from the judge that the government had to prove that funds Al-Arian contributed to various charities were used for terrorist attacks, and that Al-Arian sought to fund these attacks. The government had wanted to base its case involving financial support for terrorist activities purely on the grounds that Palestinian Islamic Jihad had some ties to charities to which the defendants gave donations.

அல்-அரியன் பல்வேறு அறக்கட்டளைகளுக்கு அளித்த நன்கொடைகள் பயங்கரவாத தாக்குதல்களுக்கு பயன்படுத்தப்பட்டன மற்றும் அல்-அரியன் இந்த தாக்குதல்களுக்கு நிதியளிக்க முயன்றார் என்பதை அரசு தரப்பு நிரூபித்தாக வேண்டும் என்று நீதிபதி ஒரு கட்டளையிட்ட பின்னர் அரசு தரப்பு வழக்கு மிகுந்த சங்கடத்திற்கு உள்ளானது.
