Programmet guidar dig, frågar var den kan hitta den vänstra bilden, och sedan var den kan hitta den högra bilden. När du har valt bilderna visas båda sida vid sida. Det tar dig till ett fönster som visar båda bilderna halvgenomskinligt. Du kan sedan dra den ena tills den stämmer bra överens med den andra. Helst vill du få de två bilderna att matcha perfekt vertikalt, och matcha upp horisontellt för saker i själva mitten av bilden. Rada upp de två bilderna så väl som du kan och klicka på OK.    Den flerfärgade ikonen till vänster om den vertikala röd-blå ikonen finns där för att se din bild som en anaglyf. Nu när du har ställt in dem, klicka på det och sätt på dig 3D-glasögonen. För att få en stor vy, klicka på ikonen som ser ut som en rektangel med en X genom den. Det ger dig en fullskärmsvy. När du har fått en tillräckligt bra titt på det, för att gå tillbaka till den vanliga programskärmen, tryck på Esc-tangenten. Gör några justeringar för att anpassa bilderna tills du är nöjd med det. Välj fil, spara stereobild. Du kanske vill ändra namnet till att det inte har en -L eller -R på den. Återigen, välj Arkiv, Öppna vänster/höger bilder, och berätta för programmet vilka filer att öppna. Välj sedan Justera, Anpassa automatiskt. Om det någonsin frågar om du vill använda tidigare rapportfiler, klicka alltid Nej. Programmet kommer att utföra sin magi jämföra de två bilderna och rada upp dem så perfekt som det kan. Om du vill kan du spara den här bilden också, kanske med ett annat namn. Du kan senare titta på de två bilderna och se hur de jämför.
Välj fil, Öppna vänster/höger bilder. Klicka på ikonen "Easy Adjustment" (K)(den röda fyrkanten överlappar den blå fyrkanten). Förhandsgranskning av anaglyfen. Spara bilden. Lägg det i din "anaglyf"-mapp. Experimentera med Auto-Align.