Ju mer data du samlar in, desto bättre. Till exempel, anta att allelerna A1 och B1 en locus 1 kom från en förälder, och A2 och B2 på locus 2 kom från den andra. Avkomman som ärver A1B1 eller A2B2 är icke - rekombinant medan de som ärver A1B2 eller A2B1 är rekombinanta. Detta ges av ((R/(R+NR))^R)*((1-(R/(R+NR)))^NR), där R = antal rekombinanta, NR = antal icke-rekombinanter.  Till exempel, i MNS blodgrupp systemet, M och S är kopplade, och N och s är kopplade. Antag att i 100 slumpmässiga individer, 25 har MS haplotype, 30 har Ms haplotype, 6 har NS haplotype och 39 har Ns haplotype. Eftersom M och S är sammankopplade och N och s är sammankopplade, är MS och N inte rekombinanta och Ms och NS är rekombinanta. Antalet rekombinanta ämnen = R = 30+ 6 = 36, medan antalet icke-rekombinanter = NR = 25 + 39 = 64. Den rekombinanta frekvensen är R/(R+NR) = 36/(36+64) = 0,36. Sannolikheten för att få resultaten om de två loci är kopplade är därför ((0.36)^36*((1-(0.36))^64) = 4.19187538*10^-29. Detta ges av 0,5^ (NR+R). I exemplet ovan är detta 0,5^(64+36) = 0,5^100 = 7,88860905×10^-31. Till exempel är detta lika med 4.19187538*10^-29/7.88860905×10^-31 = 53.14. Till exempel är detta lika med log 53.14 = 1.73.
Upprätta en stamtavla för två intressen. Bestäm antalet rekombinanta och antalet icke-rekombinanter. Beräkna sannolikheten för att få resultaten förutsatt att de två loci är kopplade. Beräkna sannolikheten för att få resultaten förutsatt att de två loci inte är kopplade. Dividera sannolikheten för att få resultaten under förutsättning att de två loci är kopplade (från steg 3 ovan), med sannolikheten för att få resultaten förutsatt att de två loci inte är kopplade (från steg 4 ovan). Ta basen 10 logaritm av kvoten som erhållits ovan (steg 5).