Enligt Världshälsoorganisationen (WHO) är den säkraste och mest effektiva formen av förebyggande av japansk encefalit att vaccineras mot den. De fyra huvudtyper av vacciner som för närvarande används för att förhindra JEV-infektion är ett inaktiverat hjärnderiverat musvaccin, ett inaktiverat Verocellderiverat vaccin, ett levande försvagat vaccin och ett levande rekombinant vaccin. Vaccinera dig minst sex till åtta veckor före din resa till Asien för att ge kroppen tillräckligt med tid för att bygga upp skyddande antikroppar.  Det vanligaste vaccinet mot JEV-infektion är det levande försvagade SA14-14-2-vaccinet som tillverkas i Kina.  De högre riskområdena i Asien för japansk encefalit är de landsbygdsområden i Japan, Kina eller Sydostasien — bli vaccinerade innan du går till dessa platser för att minska din risk. Den japanska encefalitvaccinationen kan kräva flera doser under loppet av några veckor eller månader Tänk på att encefalit faktiskt kan orsakas eller förvärras av vaccination (alla typer av vaccin) på grund av en allergisk reaktion mot ingredienserna. En annan form av skydd mot JEV-infektion är att kontrollera myggor och undvika att bli bitna, eftersom insekterna är den huvudsakliga vektorn för sjukdomen. Undvik eller avlägsna alla källor till stående vatten där myggor kan avla och alltid använda ett insektsmedel som innehåller en kemikalie som kallas DEET (Off!, Cutter, Sawyer, Ultrathon). Dessutom sover du i sängar med skyddande myggnät (eller andra täcken) och undviker att gå ut mellan skymning och gryning när fler myggor är aktiva och luftburna.  De flesta insektsmedel håller i upp till sex timmar och vissa är vattenresistenta. DEET-produkter ska inte användas på spädbarn yngre än två månader. Naturliga former av insektsmedel inkluderar citronolja och eukalyptusolja. Förhindra myggor från att bita dig när du reser utomlands kommer också att minska risken för att få andra allvarliga sjukdomar, såsom malaria och West Nile virus. Förutom att använda insektsmedel och myggnät, bör du också bära lämpliga skyddskläder när du reser i Asien, särskilt på landsbygden. Som sådan, bär långärmad skjorta och tunna bomullshandskar (populära i många asiatiska länder) för att täcka hela dina armar och händer. För dina ben, bär långa byxor med strumpor och skor när du är ute, särskilt när du går i sumpiga eller gräsiga områden.  Asien är mycket varmt och fuktigt under större delen av året, så välj andningsbara byxor och långärmade skjortor så att du inte blir överhettad. Men kom ihåg att myggor kan bita genom tunna kläder, så spraya dina kläder med insektsmedel för att vara på den säkra sidan. Använd inte insektsmedel som innehåller permetrin på huden. Om du är i Asien, undvika aktiviteter som avsevärt ökar risken för att bli biten och infekterad av mygg, såsom utomhus camping, vandring och utforska på motorcyklar eller cyklar. Inte bara dessa aktiviteter vanligtvis görs i landsbygdsområden, men du är också sårbar på grund av exponering. Välj sightseeingturer i slutna fordon (turbussar) medan på landsbygden och bära skyddskläder, som nämnts ovan.  Om du absolut måste sova utomhus på landsbygden i Asien, då är det viktigt att täcka ditt tält eller bo i myggnät som är impregnerade med ett starkt insektsmedel. Medan på landsbygden, bara sova i hotellrum med närsittande gasbinda eller skärmar över fönster och dörrar. En annan form av förebyggande, om än drastisk, är att inte resa till asiatiska länder som är kända för att vara endemiska för japansk encefalit — som faktiskt är de flesta länder i Asien. Detta är lätt råd att följa för en nyfiken resenär utan familjeband eller förbindelser till Asien, men inte praktiskt för många människor som måste resa dit av affärs- eller familjeskäl. I själva verket är risken för att bli smittad mycket, mycket liten — man beräknar att mindre än en av en miljon resenärer som reser till Asien utvecklar japansk encefalit per år.  Mer praktiska råd är att undvika landsbygden i Asien om du reser dit, särskilt jordbruksområden med många grisar och kor. De personer som löper störst risk för JEV-infektion är de som bor och arbetar i landsbygdsområden där sjukdomen är utbredd, särskilt barn under 15 år.  Om du har ett val, undvika att resa till asiatiska länder under sina regniga årstider (det varierar från plats till plats) när myggpopulationer är större och mer av ett hot.
Bli vaccinerad. Undvik myggbett. Bär skyddskläder. Undvik riskfyllda utomhusaktiviteter. Res inte till Asien.