Om datorn du ansluter din iPod till inte har din iTunes Library på det, kommer du att uppmanas att ta bort allt på iPod när synkning. Det enda sättet att undvika detta är genom att synka på en dator som innehåller ditt iTunes-bibliotek. Om du inte vill använda iTunes, kan du använda ett program som Sharepod, men nästan alla tredje part program fortfarande kräver iTunes att installeras för att fungera. Ändå kan de vara mycket användbara om du försöker hantera din musik på en dator som inte är din och du inte vill att all din musik tas bort när du synkar. Klicka här för mer instruktioner om hur du använder ett tredjepartsprogram. Om du använder iTunes 11, välj det i menyn Enheter. Detta bör öppna fliken "Sammanfattning". Klicka på Verkställ. Detta gör att du kan välja och välja låtar att ta bort. Detta kommer att lista all musik som för närvarande lagras på iPod. Du kan hålla Shift och välja flera spår för att ta bort mer på en gång. Du måste bekräfta att du vill ta bort spåren. Om du tar bort en massa låtar på en gång, kan det ta några minuter för dem alla att tas bort. Du kan övervaka utvecklingen högst upp iTunes-fönstret.
Anslut din iPod till datorn med hjälp av dess USB-synkroniseringskabel. Öppna iTunes. Välj din iPod från raden av knappar längs toppen av iTunes. Markera rutan "Manuellt hantera musik" längst ner på översiktsskärmen. Välj "Musik" i menyn "På min enhet". Högerklicka på den låt du vill ta bort och välj "Ta bort". Vänta tills borttagningsprocessen är klar.