Kom i vana att rengöra din neti potta med tvål och vatten så fort du är klar med det. Då behöver du aldrig oroa dig för kvarvarande bakterier eller mineraluppbyggnad. Du bör också köra din neti potten genom diskmaskinen med jämna mellanrum för att ge det en fullständig sanitizing.  Skumma inte på rengöringsprocessen. En enkel sköljning räcker inte för att effektivt rensa bort skadliga bakterier. Desinficera din neti pott är nyckeln till att öva säker, ansvarsfull hygien. Det kan vara farligt att bevattna bihålorna med vanligt kranvatten. Använd istället destillerat vatten eller renat vatten på flaska. Du kan också koka en liter vatten och använda det för att rengöra dina näsgångar efter att ha låtit det svalna till rumstemperatur.  Alla möjliga slags vidriga saker, från kaustiska kemikalier till mikroskopiska hjärnätande amöbor, har varit kända för att ligga i vatten direkt från kranen. Om du förbereder sterilt vatten för din netin kanna hemma, se till att föra vattnet till en stadig koka i inte mindre än en minut. Eftersom det ofta finns en del bakterier kvar på pipen efter att den har varit inne i näsgångarna, ökar risken för överföring av dessa bakterier genom att låta någon annan använda din netipott. Detta gäller även om enheten har rengjorts mellan användningarna. Spela det säkert och se till att dina bihålor är de enda som din neti pott ser. Neti krukor är som tandborstar, loofahs eller kvarsittare – alla bör ha sina egna.
Tvätta din neti-kruka efter varje användning. Använd rätt typ av vatten. Dela inte din neti potta med någon annan.