Motivering: Nya studier har funnit många proteiner som innehåller regioner som inte bildar väldefinierade tredimensionella strukturer i sina hemländer. Studien och detektionen av sådana oordnade regioner är viktig både för att förstå proteinfunktion och för att underlätta strukturanalys eftersom oordnade regioner kan påverka löslighet och/eller kristallibilitet. Resultat: Vi har utvecklat den regionala ordningen neurala nätverk (RONN) programvara som en tillämpning av vår nyligen utvecklade "biobasis funktion neurala nätverk" mönsterigenkänning algoritm till upptäckt av naturligt oordnade regioner i proteiner. Resultaten av blind-testing en panel av nio sjukdomsförutsägelse verktyg (inklusive RONN) mot 80 proteinsekvenser som härrör från Protein Data Bank visar att, baserat på sannolikheten överskottsmått, gjorde RONN bäst. Tillgänglighet: RONN finns på http://www.strubi.ox.ac.uk/RONN. Begäran om RONN-programvaran och databasen av oordning (XML-format) kan riktas till motsvarande författare. Kontaktperson: robert@strubi.ox.ac.uk Kompletterande information: Uppgifter om alla förutsägelser som gjorts vid blindtest, även tillgängliga på http://www.strubi.ox.ac.uk/RONN3_ Supplementary.pdf
RONN REF klassificerar oordnade regioner på grundval av observerad homologi mellan proteinsekvenser.
RONN : the bio-basis function neural network technique applied to the detection of natively disordered regions in proteins
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Computer Science']}