Databaser har blivit en integrerad del av datahantering, spridning och gruvdrift inom biologi. Vid den andra årliga konferensen om elektrontomografi, som hölls i Amsterdam 2001, föreslog vi att data om elektrontomografi skulle delas på ett sätt som är jämförbart med strukturdata på protein- och sekvensskalan. Vid den tiden beskrev vi våra framsteg med att skapa en databas för att sammanföra data från cellnivåbilder över skalor, The Cell Centered Database (CCDB). CCDB lanserades formellt 2002 som en online-förråd av högupplösande 3D-ljus och elektronmikroskopiska rekonstruktioner av celler och subcellulära strukturer. Den innehåller 2D-, 3D- och 4D-struktur- och proteinfördelningsinformation från konfokal, multifoton och elektronmikroskopi, inklusive korrelerad ljus- och elektronmikroskopi. Många av datamängderna härrör från elektrontomografi av celler och vävnader. Under de fem år som gått sedan debuten har vi flyttat CCDB från en prototyp till en stabil resurs och utökat tillämpningsområdet för projektet till att omfatta datahantering och kunskapsutveckling. Här ger vi en uppdatering om CCDB och hur det används av forskarsamhället. Vi beskriver också vårt arbete med att utveckla ytterligare kunskapsverktyg, t.ex. ontologier, för annotering och frågeställning av elektronmikroskopiska data.
Cellcentrerad databas (CCDB) är ett online-arkiv för hantering och delning av bilddata REF.
THE CELL CENTERED DATABASE PROJECT: AN UPDATE ON BUILDING COMMUNITY RESOURCES FOR MANAGING AND SHARING 3D IMAGING DATA
{'venue': 'Journal of structural biology', 'journal': 'Journal of structural biology', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}