Abstrakt. Fokus för pankreascancerforskningen har förskjutits från cancerceller i pankreas till mikromiljö, med pankreastellatceller som interagerar med cancerceller och påverkar tumörprogression. För att kvantitativt förstå pankreascancermikromiljö konstruerar vi en beräkningsmodell för intracellulära signalnätverk av cancerceller och stellatceller samt deras intercellulära kommunikation. Vi utökar det regelbaserade BioNetGen-språket till att avbilda intra- och intercellulär dynamik med hjälp av diskreta respektive kontinuerliga variabler. Vårt ramverk möjliggör också en statistisk modell kontroll procedur för att analysera systemets beteende som svar på olika störningar. Resultaten visar den prediktiva kraften hos vår modell genom att identifiera viktiga systemegenskaper som överensstämmer med befintliga experimentella observationer. Vi får också intressanta insikter i utvecklingen av nya terapeutiska strategier för pankreascancer.
Wang m.fl. REF utökar det regelbaserade BioNetGen-språket för att möjliggöra specifikationen av interaktioner mellan mer än en cell.
Formal Modeling and Analysis of Pancreatic Cancer Microenvironment
{'venue': 'CMSB', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Mathematics', 'Biology']}