Elektroniska patientjournaler (EHR) utgör en rik och relativt outnyttjad resurs för att karakterisera den kliniska praktikens verkliga natur och för att kvantifiera graden av inbördes samband mellan medicinska enheter såsom läkemedel, sjukdomar, förfaranden och utrustning. Vi tillhandahåller en unik uppsättning co-occurence matriser, kvantifierar pairwise nämner 3 miljoner termer kartlagda på 1 miljon kliniska begrepp, beräknade från den råa texten av 20 miljoner kliniska anteckningar som sträcker sig över 19 år av data. Samfrekvenser beräknades med hjälp av en parallell annotation, hashing, och räkna pipeline som tillämpades över kliniska anteckningar från Stanford Hospitals och Clinics. Co-occurence-matrisen kvantifierar relationen mellan medicinska begrepp som kan ligga till grund för många statistiska tester, och kan användas för att direkt beräkna Bayesian villkorliga sannolikheter, föreningsregler, samt en rad teststatistik såsom relativa risker och oddsförhållanden. Denna datauppsättning kan användas för att kvantitativt bedöma komorbiditet, narkotika och läkemedelssjukdomar för en rad olika kliniska, epidemiologiska och ekonomiska tillämpningar.
REF byggde en "graf över läkemedel" baserad på samtidig förekomst av medicinska begrepp i kliniska anteckningar.
Building the graph of medicine from millions of clinical narratives
{'venue': 'Scientific data', 'journal': 'Scientific data', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}