Bakgrund: Inom radiologi genereras en stor mängd olika data, och ostrukturerad rapportering är standard. Därför är mycket användbar information fångad i fritextform, och ofta förlorad i översättning och överföring. En relevant källa till fritextdata består av rapporter som täcker bedömningen av förändringar i tumörbördan, vilka behövs för att utvärdera cancerbehandlingens framgång. Varje förändring av lesionsstorleken är en kritisk faktor vid uppföljningsundersökningar. Det är svårt att få fram specifik information från ostrukturerade rapporter och att jämföra dem med tiden. Därför har en prototyp genomförts som visar att resultaten är strukturerade, vilket möjliggör selektiv granskning i efterföljande undersökningar och därmed en effektivare jämförelse över tiden. Metoder: Vi utvecklade en semantisk modell för klinisk information (MCI) baserad på befintliga ontologier från biblioteket Open Biological and Biomedical Ontologies (OBO). MCI används för integrerad representation av uppmätta bildfynd och medicinsk kunskap om den normala storleken på anatomiska enheter. En integrerad bild av radiologins resultat förverkligas genom en prototypimplementering av en ReportViewer. Vidare genomförs RECIST (Response Evaluation Criteria In Solid Tumors) riktlinjer genom SPARQL frågor om MCI. Utvärderingen baseras på två datauppsättningar av tyska radiologirapporter: En onkologisk datauppsättning bestående av 2584 rapporter om 377 lymfompatienter och en blandad datauppsättning bestående av 6007 rapporter om olika medicinska och kirurgiska patienter. Alla mätresultat klassificerades automatiskt som onormala/normala med hjälp av formaliserad medicinsk bakgrundskunskap, d.v.s. kunskap som har kodats in i en ontologi. En radiolog bedömde 813 klassificeringar som korrekta eller felaktiga. Alla oklassificerade resultat bedömdes som felaktiga.
I Oberkampf m.fl. REF, författarna föreslår en ontologisk modell kallad Modell för klinisk information (MCI) baserad på öppen biomedicinsk ontologi (OBOs).
Semantic representation of reported measurements in radiology