Sammanfattning: IPPRED är en webbaserad server för att härleda proteinproteininteraktioner genom homologisökning mellan kandidatproteiner och de som beskrivs som interaktion. Denna enkla slutsats gör det möjligt att föreslå eller validera potentiella interaktioner. Tillgänglighet: IPPRED är fritt tillgängligt på http://cbi.labri. fr/outils/ippred/ Kontakt: Antoine.daruvar@pmtg.u-bordeaux2.fr Kunskapen om interaktioner mellan proteiner är nödvändig för att förstå cellfunktioner. Identifieringen av dessa interaktioner är föremål för flera projekt som sträcker sig från liten till stor skala. Dessa projekt använder olika experimentella metoder såsom tvåhybridscreening eller rening av komplex följt av karakterisering av deras komponenter. För att hjälpa biologer har vi utvecklat IPPRED, en webbaserad server. IPPRED infers interaktioner genom homologi sökning mellan kandidatproteiner och de som beskrivs som interaktion. Det finns flera kända biologiska sammanhang som motiverar en sådan slutsats. Det är fallet med bevarade interaktioner mellan ortologa proteiner, såsom ribosomala proteiner eller ATPas. Det är också fallet när interagera domäner finns i olika paraloga par, såsom i CDK / cyklin komplex.
Goffard m.fl. REF utvecklade IPPRED, en webbaserad server för att dra slutsatser om proteininteraktioner.
IPPRED: server for proteins interactions inference
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Computer Science']}