Den biomedicinska litteraturen växer enormt och PubMed omfattar redan över 15 000 000 abstracts. Att hitta relevant litteratur är ett viktigt och svårt problem. Vi introducerar GoPubMed, en webbserver som gör det möjligt för användare att utforska PubMed sökresultat med Gene Ontology (GO), en hierarkiskt strukturerad vokabulär för molekylärbiologi. GoPubMed ger följande fördelar: För det första ger det en översikt över litteraturen abstracts genom att kategorisera abstracts enligt GO och därmed göra det möjligt för användare att snabbt navigera genom abstracts per kategori. För det andra visar den automatiskt allmänna ontologitermer relaterade till den ursprungliga frågan, som ofta inte ens förekommer direkt i det abstrakta. För det tredje gör det det möjligt för användare att verifiera sin klassificering eftersom GO-termer markeras i abstracts och eftersom varje term är märkt med en noggrannhetsprocent. För det fjärde, utforska PubMed abstracts med GoPubMed är användbart eftersom det visar definitioner av GO termer utan behov av ytterligare uppslag. GoPubMed är online på www.gopubmed.org. För närvarande är frågan begränsad till 100 papper per fråga. BAKGRUND
I REF presenterar författarna en webbtjänst som gör det möjligt för användare att utforska PubMed sökresultat med Gene Ontology (GO), en hierarkiskt strukturerad vokabulär för molekylärbiologi.
GoPubMed: exploring PubMed with the Gene Ontology
{'venue': 'Nucleic Acids Research', 'journal': 'Nucleic Acids Research', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Computer Science', 'Medicine']}