ABSTRACT Vi använder flödescytometri för att karakterisera jämviktsbindning av ett fluorophore-märkt trivalent modellantigen till bivalenta IgE-FceRI-komplex på RBL-celler. Vi finner att flödescytometriska mätningar överensstämmer med en jämviktsmodell för ligand-receptorbindning där bindningsställen antas vara likvärdiga och ligand-inducerade receptoraggregat antas vara acykliska. Denna modell förutsäger dock omfattande receptoraggregation vid antigenkoncentrationer som ger starka cellsekretoriska svar, vilket är oförenligt med förväntan att stora receptoraggregat bör hämma sådana svar. För att undersöka möjliga förklaringar till denna diskrepans, utvärderar vi fyra regelbaserade modeller för interaktion av en trivalent ligand med en bivalent cellyta receptor som slappnar av förenkla antaganden om jämviktsmodellen. Dessa modeller simuleras med hjälp av en regelbaserad kinetisk Monte Carlo metod för att undersöka kinetiken hos ligand-inducerad receptoraggregation och för att studera hur kinetiken och jämvikten i ligand-receptorinteraktionen påverkas av steriska begränsningar på receptoraggregatkonfigurationer och av bildandet av cykliska receptoraggregat. Resultaten tyder på att bildning av linjära kedjor av cykliska receptordämpare kan vara viktigt för att generera sekretära signaler. Steriska effekter som begränsar receptoraggregation och övergående bildning av små receptoraggregat kan också vara viktiga.
Den regelbaserade modellen utvidgades också till att omfatta sterila begränsningar REF.
Modeling multivalent ligand-receptor interactions with steric constraints on configurations of cell-surface receptor aggregates.
{'venue': 'Biophysical journal', 'journal': 'Biophysical journal', 'mag_field_of_study': ['Chemistry', 'Biology', 'Medicine']}