Vi presenterar LGA (Local-Global Alignment) metod, utformad för att underlätta jämförelse av proteinstrukturer eller fragment av proteinstrukturer i sekvensberoende och sekvens oberoende lägen. Programmet för anpassning av LGA-strukturen finns tillgängligt som en onlinetjänst på http://PredictionCenter. llnl.gov/lokal/lga. Data som genereras av LGA kan framgångsrikt användas i en poängfunktion för att rangordna graden av likhet mellan två strukturer och för att tillåta strukturklassificering när många proteiner analyseras. LGA möjliggör också klusterbildning av liknande fragment av proteinstrukturer.
När det gäller jämförelsen av proteinstrukturer presenterade Zemla en LGA-metod (Local-Global Alignment) REF som underlättar både sekvensberoende och oberoende lägen till detta problem.
LGA: a method for finding 3D similarities in protein structures
{'venue': 'Nucleic acids research', 'journal': 'Nucleic acids research', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Biology', 'Medicine']}