Vi utförde en global metyleringsprofileringsanalys på 1505 CpG-platser över 807 gener för att karakterisera DNA-metyleringsmönster i pankreascancergenomet. Vi hittade 289 CpG platser som var olika metylerade i normal bukspottkörtel, pankreastumörer och cancer cellinjer. Vi identifierade 23 och 35 kandidatgener som regleras av hypermetylering respektive hypometylering vid pankreascancer. Vi identifierade också kandidatmetyleringsmarkörer som förändrar uttrycket av gener som är kritiska mot gemcitabin känslighet vid pankreascancer. Dessa resultat indikerar att avvikande DNA-metylering är en frekvent epigenetisk händelse vid pankreascancer; och genom att använda global metyleringsprofileringsanalys, är det möjligt att identifiera dessa markörer för diagnostiska och terapeutiska ändamål i denna sjukdom. Publicerad av Elsevier B.V. Alla rättigheter förbehållna. Cancer är en komplex sjukdom som kännetecknas av flera genetiska och epigenetiska genomiska förändringar (Esteller, 2007; Feinberg et al., 2006; Jones och Baylin, 2002). DNA-metylering är en av de viktigaste epigenetiska förändringarna och spelar en viktig funktionsroll i utveckling, differentiering och sjukdomar (Jones och Baylin, 2002). Genom aktiviteten av DNA-metyltransferaser (DNMTs), DNA-metylering sker vid cytosin resterna i samband med 5 0 - CG-3 0 (CpG dinucleotid) genom humant genom (Laird, 2003). Under utvecklingsprocessen spelar DNA-metylering en viktig roll i X-kromosomens inaktivering i kvinnliga somatiska celler och i den mono-alleliska ljuddämpningen av föräldramässigt präglade gener (Herman och Baylin, 2003). När dessa DNA-metyleringsmönster har förvärvats i det tidiga embryostadiet ärvs och upprätthålls dessa mönster i successiva cellgenerationer. Arrangör regioner är vanligtvis berikade med CpG dinucleotides, känd som CpG öar; och hypermetylering av dessa öar korrelerar med transkriptionell ljuddämpande av tumörsuppressor gener (Herman och Baylin, 2003). Omvänt, ökade uttryck av onkogener förknippades med hypometylering (Cui et al., 2002). Denna hypometylering är känd för att bidra till cancerceller fenotyper genom förlust av tryck (LOI) och genomisk instabilitet som kännetecknar tumörer (Cui et al., 2002). Dessutom var tumorigenesis av flera cancerformer också präglat av specifika metylering förändringar i deras genom (Yegnasubramanian et al., 2004). Därför är det bra att konstruera en global metyleringsprofil för att upptäcka kandidatgener och förutsäga
Tan och Al. REF indikerade att avvikande DNA-metylering är en frekvent epigenetisk händelse vid pankreascancer.
Characterizing DNA methylation patterns in pancreatic cancer genome.
{'venue': 'Molecular oncology', 'journal': 'Molecular oncology', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Biology']}