ABSTRACT I detta dokument föreslår vi att vi använder den senaste utvecklingen inom kunskapsrepresentationsspråk och resonemangsmetoder för att representera och resonera om signalnätverk. Vårt tillvägagångssätt skiljer sig från de flesta andra kvalitativa system biologiska metoder genom att det bygger på resonemang (eller slutsatser) snarare än simulering. Några av fördelarna med vår strategi är, vi kan använda senaste tidens framsteg i resonemang med ofullständig och partiell information för att hantera luckor i signalnätverk kunskap; och kan utföra olika typer av resonemang såsom planering, hypotetiskt resonemang och förklara observationer. Resultat: Med vårt tillvägagångssätt har vi utvecklat systemet BioSigNet-RR för representation och resonemang kring signalnätverk. Vi använder en NFσB-relaterad signaleringsväg för att illustrera de typer av resonemang och representation som vårt system för närvarande kan göra. Tillgänglighet: Systemet är tillgängligt på webben på
För nästan tio år sen, Baral et al. har föreslagit att tillämpa kunskapsrepresentation och resonemangsmetoder på problemet med att representera och resonera om signalnätverk REF.
A knowledge based approach for representing and reasoning about signaling networks
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}