Bakgrund: Detta dokument beskriver utvecklingen av ett webbaserat verktyg, GenDrux, som extraherar och presenterar (över Internet) information om sjukdomen-gen-drog nexus. Denna information arkiveras från relevant biomedicinsk litteratur med hjälp av automatiserade metoder. GenDrux är utformad för att lindra svårigheterna med att manuellt bearbeta den omfattande biomedicinska litteraturen för att identifiera sjukdom-gen-läkemedel relationer. GenDrux kommer att utvecklas med litteraturen utan ytterligare algoritmiska modifieringar. Resultat: GenDrux, ett pilotsystem, utvecklas inom området bröstcancer och kan nås på http://www. mikroarray.uab.edu/drug_gene.pl. GenDrux kan ställas utifrån läkemedels-, gen- och/eller sjukdomsnamn. Från över 8.000 relevanta abstracts från den biomedicinska litteraturen om bröstcancer har vi arkiverat en corpus på mer än 4.000 artiklar som skildrar genuttryck-drogaktivitetsrelationer för bröstcancer och relaterade cancerformer. Arkiveringsprocessen har automatiserats. Slutsatser: Den framgångsrika utvecklingen, implementeringen och utvärderingen av detta och liknande system när de skapas kan förse kliniker med ett verktyg för litteraturhantering, kliniskt beslutsfattande och därmed sätta plattformen för personlig terapi i framtiden.
GenDrux REF, frågor PubMed att identifiera sjukdom-gen-läkemedel relationer; pilot genomförandet har tillämpats på bröstcancer området.
GenDrux: A biomedical literature search system to identify gene expression-based drug sensitivity in breast cancer
{'venue': 'BMC Medical Informatics and Decision Making', 'journal': 'BMC Medical Informatics and Decision Making', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Computer Science']}