Vi beskriver ett tillvägagångssätt för att modellera biologiska nätverk genom handlingsspråk via svarsuppsättnings-programmering. I detta syfte föreslår vi ett åtgärdsspråk för modellering av biologiska nätverk, som bygger på tidigare arbete av Baral et al. (Förfaranden vid den tolfte internationella konferensen om intelligenta system för molekylärbiologi/tredje europeiska konferensen om beräkningsbiologi (ISMB'04/ECCB'04) (s. Europaparlamentets och rådets förordning (EU, Euratom) nr 966/2012 av den 25 oktober 2012 om finansiella regler för unionens allmänna budget och om upphävande av rådets förordning (EG, Euratom) nr 1605/2002 (EUT L 298, 26.10.2012, s. 1). Vi introducerar dess syntax och semantik tillsammans med en översättning till svarsuppsättning programmering, en effektiv Boolesk Constraint programmering Paradigm. Slutligen beskriver vi en av dess tillämpningar, nämligen sulfur svält svar-väg modell växten Arabidopsis thaliana och skissa funktionaliteten i vårt system och dess användning.
I REF modelleras biologiska nätverk av åtgärdsspråk via ASP.
Modeling Biological Networks by Action Languages via Answer Set Programming
{'venue': 'Constraints', 'journal': 'Constraints', 'mag_field_of_study': ['Computer Science']}