Konsortiet Gene Ontology (GO) har producerat en kontrollerad vokabulär för annotation av genfunktion som används i många organismspecifika genannotationsdatabaser. Detta möjliggör förutsägelse av genfunktion baserat på mönster av annotation. Till exempel, om annoteringar för två attribut tenderar att uppstå tillsammans i en databas, då en gen som innehar en egenskap är sannolikt att hålla den andra också. Vi modellerade relationerna mellan GO attribut med beslut träd och Bayesian nätverk, med hjälp av kommentarer i Saccharomyces Genome Database (SGD) och i FlyBase som träningsdata. Vi testade modellerna med hjälp av korsvalidering, och vi bedömde manuellt 100 genattribut-föreningar som förutspåddes av modellerna men som inte fanns i SGD- eller FlyBase-databaserna. Av de 100 bedömda associationerna bedömdes 41 vara sanna, och ytterligare 42 bedömdes vara rimliga. [Detaljerade förteckningar över hypoteser, inklusive intendenternas synpunkter på varje hypotes, finns på
I REF, Oliver et al använt Bayesian nätverk och beslut träd för att modellera relationen mellan olika GO-kategorier ordförråd, endast 41 gener av 100 manuellt bedömdes vara sant.
Predicting Gene Function from Patterns of Annotation
{'venue': 'Genome research', 'journal': 'Genome research', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}