ChEBI (http://www.ebi.ac.uk/chebi) är en databas och ontologi för kemiska enheter av biologiskt intresse. Under de senaste åren har ChEBI fortsatt att växa stadigt i innehåll, och har lagt till flera nya funktioner. Förutom att inkorporera alla användarrequested föreningar, våra annotation ansträngningar har betonat immunologi, naturliga produkter och metaboliter i många arter. Alla databasposter är nu "is_a" klassificerade inom ontologin, vilket innebär att alla kemikalier är tillgängliga för semantiska resonemangsverktyg som utnyttjar klassificeringshierarkin. Vi har helt anpassat ontologin till Open Biomedical Ontologies (OBO) Foundryrecommended övre nivå Basic Formal Ontology. Dessutom har vi anpassat vår kemiska klassificering till klassificeringen av kemiska involverande processer i Gene Ontology (GO), och som ett resultat av detta arbete definieras nu majoriteten av kemiska involverande processer i GO i termer av de ChEBI-enheter som deltar i dem. Denna ansträngning krävde att man införlivade många ytterligare biologiskt relevanta föreningar. Vi har inkluderat ytterligare datatyper inklusive referensciteringar, samt art och komponent för metaboliter. Slutligen, vår webbplats och webbtjänster har haft flera förbättringar, främst tillhandahållandet av en dynamisk ny interaktiv graf-baserad ontologi visualisering.
Den största fördelen med detta ramverk är dess integrering med kemiska enheter av biologiskt intresse (ChEBI) ontology REF.
The ChEBI reference database and ontology for biologically relevant chemistry: enhancements for 2013
{'venue': 'Nucleic Acids Research', 'journal': 'Nucleic Acids Research', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Chemistry', 'Medicine', 'Computer Science']}