Bakgrund: Patientgenomiska data blir snabbt en del av det kliniska beslutsfattandet. Inom några år, full genom uttryck profilering och genotyping kommer att vara överkomligt nog att utföra på varje individ. Hanteringen av sådana omfattande, men ändå finkorniga, data i enlighet med integritetslagar och bästa praxis innebär betydande utmaningar när det gäller säkerhet och skalbarhet. Vi presenterar utformningen och genomförandet av GenePING, en förlängning till PING personliga hälsojournalsystem som stöder säker lagring av stora, genom-stora dataset, samt effektiv delning och hämtning av enskilda datapunkter (t.ex. SNP, sällsynta mutationer, genuttrycksnivåer). Även med full tillgång till den råa GenePING lagring, en angripare kan inte upptäcka någon lagrad genomic datapoint på någon enskild patient. Med tanke på ett stort antal patientjournaler kan en angripare inte upptäcka vilka data som motsvarar vilken patient, eller ens storleken på en viss patients journal. Den beräkningsmässiga overheaden av GenePING säkerhetsfunktioner är en liten konstant, vilket gör systemet användbart, även i akut vård, på dagens hårdvara. GenePING är det första personliga systemet för registerhantering för att stödja effektiv och säker lagring och delning av stora genomiska dataset. GenePING finns tillgängligt online på
Adida och Kohane REF föreslog ett system GenePING för säker lagring av stora, genomstora datamängder.
GenePING: secure, scalable management of personal genomic data
{'venue': 'BMC Genomics', 'journal': 'BMC Genomics', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine', 'Computer Science']}