Oönskade biverkningar av läkemedel är en börda för patienterna och ett allvarligt hinder i utvecklingen av nya läkemedel. Samtidigt är biverkningar som registrerats under kliniska prövningar en viktig källa till fenotypiska data från människa. Det är därför viktigt att kombinera data om läkemedel, mål och biverkningar till en mer fullständig bild av den terapeutiska verkningsmekanismen för läkemedel och de sätt på vilka de orsakar biverkningar. Därför har vi skapat SIDER-databasen (Side Effect Resource, http://sideeffects.embl.de) för läkemedel och biverkningar. Den nuvarande versionen, SIDER 4, innehåller data om 1430 läkemedel, 5880 biverkningar och 140 064 läkemedels-ADR par, vilket är en ökning med 40 % jämfört med den tidigare versionen. För mer finkorniga analyser extraherade vi frekvensen med vilka biverkningar uppstår från förpackningsinläggen. Denna information finns tillgänglig för 39% av läkemedels-ADR par, varav 19% kan jämföras med frekvensen under placebobehandling. SIDER innehåller dessutom en uppsättning uppgifter om läkemedelsindikationer som hämtats från förpackningarna med hjälp av Natural Language Processing. Dessa läkemedelsindikationer används för att minska andelen falska positiva effekter genom att identifiera medicinska termer som inte motsvarar biverkningar.
Kuhn m.fl. REF skapade en databas över läkemedel och biverkningar.
The SIDER database of drugs and side effects
{'venue': 'Nucleic Acids Research', 'journal': 'Nucleic Acids Research', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Computer Science', 'Biology']}