med en översikt (1A) och detaljer (1B) matris. Snippet vyn (2) presenterar regioner av matrisen som interaktiva små multiplar. I detta exempel arrangeras snippets med t-SNE (2C) och en hög med snippets med ett väluttalat genomsnittsmönster markeras (2A). Visa menyer för drift finns längst ner (1C och 2B). Abstract-This paper presenterar ett interaktivt visualiseringsgränssnitt-HiPiler-för utforskning och visualisering av regioner-av-intresse i stora genominteraktionsmatriser. Genominteraktionsmatriser ungefärligt det fysiska avståndet av par av regioner på genomet till varandra och kan innehålla upp till 3 miljoner rader och kolumner med många glesa regioner. Regioner av intresse (ROI) kan definieras, t.ex. genom uppsättningar av angränsande rader och kolumner, eller genom specifika visuella mönster i matrisen. Men traditionella matrisaggregation eller pan-and-zoom gränssnitt misslyckas med att stödja sökning, inspektion och jämförelse av ROI i sådana stora matriser. I HiPiler, ROI är förstklassiga objekt, representeras som miniatyr-liknande "snippets". Snippets kan utforskas interaktivt och grupperas eller läggas ut automatiskt i scatterplots, eller genom dimensionsreduktionsmetoder. Snippets är kopplade till hela den navigabla genominteraktionsmatrisen genom borstning och länkning. Designen av HiPiler bygger på en serie halvstrukturerade intervjuer med 10 domänexperter involverade i analys och tolkning av genominteraktionsmatriser. Vi beskriver sex prospekteringsuppgifter som är avgörande för analys av interaktionsmatriser och visar hur HiPiler stöder dessa uppgifter. Vi rapporterar om en användarstudie med en serie dataprospekteringssessioner med domänexperter för att bedöma användbarheten av HiPiler samt för att demonstrera respektive resultat i data.
HiPiler REF stöder utforskning och jämförelser av många mönster genom interaktiva små multiplar av många små mönster i en separat vy.
HiPiler: Visual Exploration of Large Genome Interaction Matrices with Interactive Small Multiples
{'venue': 'IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics', 'journal': 'IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Computer Science']}