Bakgrund: Tekniska förbättringar har minskat sekvenseringskostnaderna och därför har storleken och antalet genomiska dataset ökat snabbt. På grund av de lägre kostnaderna produceras nu stora mängder sekvensdata av små till medelstora forskargrupper. Crossbow är ett programvaruverktyg som kan upptäcka enstaka nukleotidpolymorphisms (SNPs) i helgenome sekvensering (WGS) data från en enda person; Crossbow har dock ett antal begränsningar när det tillämpas på flera försökspersoner från storskaliga WGS-projekt. De datalagrings- och CPU-resurser som krävs för storskaliga helgenomsekvenseringsanalyser är för stora för att många kärnanläggningar och enskilda laboratorier ska kunna tillhandahålla. För att möta dessa utmaningar har vi utvecklat Rainbow, ett molnbaserat programvarupaket som kan bidra till automatiseringen av storskaliga WGS-dataanalyser.
Rainbow REF är ett molnbaserat programvarupaket som kan hjälpa till med automatiseringen av storskaliga helgenomsekvenseringsanalyser (WGS).
Rainbow: a tool for large-scale whole-genome sequencing data analysis using cloud computing
{'venue': 'BMC Genomics', 'journal': 'BMC Genomics', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}