Den senaste tidens framsteg inom teknik och metodik har lett till ökande mängder alltmer komplexa neurovetenskapsdata som registrerats från olika arter, modaliteter och studienivåer. Den snabba datatillväxten har gjort effektiv dataåtkomst och flexibel, maskinläsbar data annotation till en avgörande förutsättning för neuroforskare. Tydlig och konsekvent annotering och organisation av data är inte bara en viktig ingrediens för reproducerbarhet av resultat och återanvändning av data, men också avgörande för samarbete forskning och datadelning. I synnerhet kräver effektiv datahantering och interoperabilitet ett enhetligt tillvägagångssätt som integrerar data och metadata och ger ett gemensamt sätt att få tillgång till denna information. I den här artikeln beskriver vi GNData, en datahanteringsplattform för neurofysiologiska data. GNData tillhandahåller ett lagringssystem baserat på en datarepresentation som är lämplig för att organisera data och metadata från alla elektrofysiologiska experiment, med en funktionalitet som exponeras via ett gemensamt programprogrammeringsgränssnitt (API). Datarepresentation och API-struktur är kompatibla med befintliga metoder för data- och metadatarepresentation inom neurofysiologi. API-implementationen baseras på Representational State Transfer (REST), som möjliggör integrering av dataåtkomst i programvaruapplikationer och underlättar utvecklingen av verktyg som kommunicerar med tjänsten. Kundbibliotek som interagerar med API ger direkt dataåtkomst från datormiljöer som Matlab eller Python, vilket möjliggör integrering av datahantering i forskarens experimentella rutiner eller analysrutiner.
Utöver dataformatet syftar plattformen för hantering av GNData-signaler till att utveckla ett gemensamt lagringslager med ett generiskt API baserat på Representation State Transfer (REST) webbtjänster för signaldataanmärkning och åtkomstkontroll REF.
Integrated platform and API for electrophysiological data
{'venue': 'Front. Neuroinform.', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}