Den nyligen föreslagna statistiska temperaturmolekylär dynamik  på STMD en algoritm  på Kim et al., Phys. Upp. Lått. 97, 050601  under 2006 har använts som kärnan i en optimeringsalgoritm, statistisk temperatur glödgning, för att hitta lågliggande energiminima av komplexa potentiella energilandskap. Eftersom STMD inser en slumpmässig gång i energi, tanken är helt enkelt att initiera upprepade minimeringar från konfigurationer i lågenergisegmenten av STMD banor. STA testas i strukturell optimering av olika off-lattice AB och utökade AB proteinmodeller i två och tre dimensioner med olika kedjelängder. Nya grundtillstånd hittades för det två- och tredimensionella AB 55-mer, och för det tredimensionella förlängda AB 21-mer och 55-mer. De distinkta hopfällbara egenskaperna hos modellerna analyseras i termer av statistisk temperatur och andra representationer av strukturen i det potentiella energilandskapet. Det visas att det karakteristiska beteendet hos den statistiska temperaturen genomgår en kvalitativ förändring med införandet av en torsionell potential i den utvidgade AB-modellen, eftersom den styvare ryggraden gör det potentiella energilandskapet mer trattliknande.
Den statistiska temperaturen molekylär dynamik baserad algoritm "statistisk temperatur glödgning" applicerades på en AB-modell i REF.
Structure optimization and folding mechanisms of off-lattice protein models using statistical temperature molecular dynamics simulation: Statistical temperature annealing
{'venue': 'Physical review. E, Statistical, nonlinear, and soft matter physics', 'journal': 'Physical review. E, Statistical, nonlinear, and soft matter physics', 'mag_field_of_study': ['Physics', 'Medicine']}