Nätverksutbredning är en viktig och allmänt använd algoritm i systembiologi, med tillämpningar i proteinfunktionsförutsägelse, sjukdomsgenprioritering, och patient stratifiering. Fram till denna punkt har den dock krävt betydande sakkunskap för att kunna drivas. Här utökar vi det populära nätverksanalysprogrammet Cytoscape för att utföra nätverksutbredning som en integrerad funktion. En sådan integration ökar i hög grad tillgången till nätverksutbredning genom att den läggs i biologers händer och kopplas till de många andra typer av nätverksanalyser och visualiseringar som finns tillgängliga via Cytoscape. Vi demonstrerar kraften och nyttan av algoritmen genom att identifiera mutationer som ger resistens mot Vemurafenib. "Detta är en PLOS Computational Biology Software papper."
Nätverksutbredning har blivit en krävande teknik i beräkningssystembiologi med fokus på proteinfunktionsförutsägelse, prioritering av sjukdomsgen och stratifiering REF.
Network propagation in the cytoscape cyberinfrastructure
{'venue': 'PLoS Computational Biology', 'journal': 'PLoS Computational Biology', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}