En grafisk metod presenteras för att visa mönstren i en uppsättning inpassade sekvenser. De tecken som representerar sekvensen staplas ovanpå varandra för varje position i de justerade sekvenserna. Höjden på varje bokstav görs proportionell mot dess frekvens, och bokstäverna sorteras så den vanligaste är på toppen. Höjden på hela stacken justeras sedan för att ange informationsinnehållet i sekvenserna vid den positionen. Från dessa "sekvenslogotyper" kan man bestämma inte bara konsensussekvensen utan också den relativa frekvensen av baser och informationsinnehållet (mätt i bitar) vid varje position i en plats eller sekvens. Logotypen visar både signi cant rester och subtila sekvensmönster. INLEDNING En logotyp är ett enda stycke av typ som bär två eller flera vanligen separata element" 1]. I detta papper använder vi logotyper för att visa anpassade uppsättningar av sekvenser. Sequence logos koncentrerar följande information till en enda grafisk 2]: 1. Det allmänna samförståndet om sekvenserna.
I bioinformatik har en konvention av sekvenslogotypen utvecklats för att möjliggöra visning av en rad MSA-funktioner i en enda grafik: konsensussekvensen, relativa frekvenser av rester i varje position, mängden information som finns i varje position mätt i bitar, samt betydande platser i indatajusteringen.
Sequence Logos: A New Way to Display Consensus Sequences
{'venue': 'Nucleic Acids Res', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Biology']}