Vi beskriver FrameD, ett program som förutsäger kodning regioner i prokaryotiska och mogna eukaryotiska sekvenser. Inledningsvis inriktad på genförutsägelse i bakteriell GC rika genom, den genmodell som används i FrameD gör det också möjligt att förutsäga gener i närvaro av frameshifts och delvis obestämda sekvenser som gör det också mycket lämpligt för genförutsägelse och frameshift korrigering i oavslutade sekvenser såsom EST och EST klustersekvenser. Liksom nyligen eukaryotiska gen förutsägelser program, FrameD inkluderar också förmågan att ta hänsyn till proteinlikhet information både i sin förutsägelse och dess grafiska utdata. Dess prestationer utvärderas på olika bakteriella genom. Webbplatsen (http://genopole.toulouse.inra.fr/bioinfo/FrameD/FD) möjliggör direkt förutsägelse, sekvenskorrigering och översättning och förmågan att lära sig nya modeller för nya organismer.
Framed Ref bygger på en riktad acyklisk graf för genförutsägelse i närvaro av frameshifts.
FrameD : a flexible program for quality check and gene prediction in prokaryotic genomes and noisy matured eukaryotic sequences
{'venue': 'Nucleic acids research', 'journal': 'Nucleic acids research', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine', 'Biology']}