Denna artikel presenterar en webbserver iPDA, som syftar till att identifiera de oordnade regionerna av ett frågeprotein. Automatisk förutsägelse av oordnade regioner från proteinsekvenser är ett viktigt problem i studiet av strukturell biologi. Den föreslagna klassificeringen DisPSSMP2 skiljer sig från flera befintliga sjukdomsprediktorer genom sin anställning av positionsspecifika poängmatriser med avseende på fysikalisk-kemiska egenskaper (PSSMP), där de fysikalisk-kemiska egenskaper som antas här särskilt ta sjukdomsbenägenhet aminosyror i beaktande. Webbservern iPDA integrerar DisPSSMP2 med flera andra sekvensprediktorer för att undersöka den funktionsroll som den upptäckta oordnade regionen har. Den förutsagda informationen omfattar sekvensbevarande, sekundär struktur, sekvens komplexitet och hydrofobiska kluster. Enligt andelen av de sekundära strukturelement som förutses, justerar iPDA dynamiskt skärtröskeln för bestämning av proteinsjukdom. Dessutom är ett mönster gruvpaket för att upptäcka sekvensbevarande inbäddat i iPDA för att upptäcka potentiella bindande regioner av frågeproteinet, vilket verkligen är till hjälp för att avslöja förhållandet mellan proteinfunktion och dess primära sekvens. Webbtjänsten finns på
PSSM med avseende på aminosyrors fysikalisk-kemiska egenskaper används också i iPDA-servern REF och dess underliggande DisPSSMP-prediktor.
iPDA: integrated protein disorder analyzer
{'venue': 'Nucleic Acids Research', 'journal': 'Nucleic Acids Research', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine', 'Computer Science']}