Bakgrund: Biologisk kunskap, och därför Gene Ontology annotation sätter, för mänskliga gener är ofullständig. Nyligen genomförda studier har rapporterat att fördomar i tillgängliga GO-anteckningar resulterar i fördomsfulla uppskattningar av funktionella likheter av gener, men det är fortfarande oklart vad effekten av själva ofullständigheten kan vara, även i frånvaro av fördomar. Parvis gen likheter används i ett antal sammanhang, inklusive gen "funktionell likhet" klustering och det relaterade problemet med funktionell ontologi struktur inferens, men det är inte känt hur olika likhet mäter eller klustering metoder utför på denna uppgift, och hur kluster påverkas av annotation fullständighet.
Liu m.fl. REF tyder på att partiskheterna i de tillgängliga GO-anteckningarna också resulterar i partiska uppskattningar av genfunktionella likheter.
GO functional similarity clustering depends on similarity measure, clustering method, and annotation completeness
{'venue': 'BMC Bioinformatics', 'journal': 'BMC Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Biology', 'Medicine']}