Interaktiv visuell analys av biologiska data med hög genomströmning i samband med de underliggande nätverken är en viktig uppgift inom modern biomedicin med tillämpningar som sträcker sig från metabolisk teknik till personlig medicin. De komplexa och heterogena datamängderna kräver flexibla programvaruarkitekturer för dataanalys. Kortfattad och lättläslig grafisk representation av data och interaktiv navigering av stora datamängder är av avgörande betydelse i detta sammanhang. Vi presenterar BiNA -the Biological Network Analyzer - en flexibel öppen källkod programvara för att analysera och visualisera biologiska nätverk. Mycket konfigurerbara visualiseringsstilar för regulatoriska och metaboliska nätverksdata erbjuder sofistikerade ritningar och intuitiva navigerings- och prospekteringstekniker med hierarkiska grafkoncept. Det allmänna ramverket för projektion och analys ger kraftfulla funktioner för visuella analyser av höggenomströmningsdata inom ramen för nätverk, särskilt för differentialanalys och analys av tidsseriedata. Ett direkt gränssnitt till ett underliggande datalager ger snabb tillgång till ett brett spektrum av semantiskt integrerade biologiska nätverksdatabaser. Ett plugin-system möjliggör enkel anpassning och integration av nya analysalgoritmer eller visuella representationer. BiNA finns under 3-klausulen BSD-licensen på http://bina.unipax.info/.
För vad gäller visuella analyslösningar, Gerasch et al. I REF föreslås ett system för visuell analys av data med hög genomströmning inom ramen för nätverk, särskilt för differentialanalys och analys av data i tidsserier.
BiNA: A Visual Analytics Tool for Biological Network Data
{'venue': 'PLoS ONE', 'journal': 'PLoS ONE', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}