Detta papper visar enkla dynamiska programmeringsalgoritmer för RNA sekundär struktur förutsägelse med pseudoknots. För en grundläggande version av problemet (dvs. att maximera antalet baspar), presenterar detta papper en O(n 4) tid exakt algoritm och en O(n 4- ) tid approximation algoritm. Den senare en outputs, för de flesta RNA-sekvenser, en sekundär struktur där antalet baspar är minst 1 - av den optimala, där ; är några konstanter som uppfyller 0i ; ¡1. Flera relaterade resultat visas också. - Vad är det med dig?
Algoritmen hade O (n^4) komplexitet, och baserades på base-pair maximization REF.
Dynamic programming algorithms for RNA secondary structure prediction with pseudoknots
{'venue': 'Discrete Applied Mathematics', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Mathematics']}