Precision Medicine Track i BioCreative VI syftar till att sammanföra BioNLP-gemenskapen för en ny utmaning med fokus på att utvinna den biomedicinska litteraturen i sökandet efter mutationer och protein-proteininteraktioner (PPI). För att stödja detta spår med en effektiv utbildning dataset med begränsad curatortid, spår arrangörerna noggrant granskat PubMed artiklar från två olika källor: kurerade offentliga PPI-databaser, och resultaten av toppmoderna offentliga text gruv verktyg. Här redogör vi för datainsamlingen, den manuella gransknings- och kommentarsprocessen och beskriver denna utbildning corpus egenskaper. Vi beskriver också en corpus prestanda baslinje. Denna analys kommer att ge användbar information till utvecklare och forskare för att jämföra och utveckla innovativa textbrytningsmetoder för BioCreative VI-utmaningen och andra Precision Medicin relaterade applikationer.
Precision Medicin Spår av BioCreative VI REF introducerade en stor datauppsättning av protein-protein interaktioner som påverkas av mutationer.
BioCreative VI Precision Medicine Track: creating a training corpus for mining protein-protein interactions affected by mutations
{'venue': 'BioNLP', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Engineering']}