Vi visar att kontaktkartan över den inhemska strukturen av globulära proteiner kan rekonstrueras med utgångspunkt från den enda kunskapen om kontaktkartans huvudegenvekator, och presentera en exakt algoritm för detta ändamål. Vår algoritm ger en unik kontaktkarta för alla 221 globulära strukturer av PDBselect25 längd N ≤ 120. Vi visar också att de rekonstruerade kontaktkartorna i sin tur möjliggör en korrekt rekonstruktion av den tredimensionella strukturen. Dessa resultat indikerar att den reducerade vektoriska representation som tillhandahålls av kontaktkartans huvudeigenvektor är likvärdig med själva proteinstrukturen. Denna representation förväntas ge ett användbart verktyg i bioinformatikalgoritmer för proteinstrukturjämförelse och anpassning, samt ett lovande mellanliggande steg mot proteinstrukturförutsägelse.
REF baserad på kontaktmatrisens huvudutgivare.
Reconstruction of protein structures from a vectorial representation
{'venue': 'Phys. Rev. Lett. 92, 218101 (2004)', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Physics', 'Biology']}