Bakgrund: Ontologier används alltmer för att strukturera och semantiskt beskriva entiteter av domäner, såsom gener och proteiner i livsvetenskaper. Deras ökande storlek och den höga frekvensen av uppdateringar som resulterar i en stor uppsättning ontologiska versioner kräver effektiv hantering och analys av dessa data. Resultat: Vi presenterar GOMMA, en generisk infrastruktur för att hantera och analysera life science ontologies och deras utveckling. GOMMA använder ett generiskt arkiv för att på ett enhetligt och effektivt sätt hantera ontologiska versioner och olika typer av kartläggningar. Dessutom ger det komponenter för ontologi matchning, och avgörande evolutionära ontologi förändringar. Dessa komponenter används av analysverktyg, såsom Ontology Evolution Explorer (OnEX) och upptäckt av instabila ontologi regioner. Vi introducerar den komponentbaserade infrastrukturen och visar analysresultat för utvalda komponenter och life science applikationer. GOMMA finns på http:// dbs.uni-leipzig.de/GOMMA.
GOMMA REF tillhandahåller infrastruktur för hantering av matchning och utveckling av ontologier och dess inverkan på kartläggningar.
GOMMA: a component-based infrastructure for managing and analyzing life science ontologies and their evolution
{'venue': 'Journal of Biomedical Semantics', 'journal': 'Journal of Biomedical Semantics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}