Till skillnad från den typiska analysen av enstaka markörer i genom-omfattande associationsstudier (GWAS), införlivade vi Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) och hypergeometric test och kombinerade dem med Fishers kombinerade metod för att utföra väg-baserad analys för att upptäcka geners kombinerade effekter på medierande schizofreni. Några vägar befanns genomgående vara högst rankade och sannolikt förknippade med schizofreni med dessa metoder; de är relaterade till metabolism av glutamat, processen för apoptos, inflammation och immunförsvar (t.ex. glutamatmetabolismväg, TGF-beta signalväg och TNFR1-väg). De gener som var involverade i dessa vägar hade inte upptäckts genom singelmarköranalys, vilket tyder på att detta tillvägagångssätt kan komplettera den ursprungliga analysen av GWAS dataset.
Genom att undvika singelmarköranalys införlivade författarna i REF även Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) och hypergeometric test, och kombinerade dem med Fishers kombinerade metod för att utföra vägbaserad analys för att upptäcka geners kombinerade effekter på medierande schizofreni.
Common variants conferring risk of schizophrenia: A pathway analysis of GWAS data
{'venue': 'Schizophrenia research', 'journal': 'Schizophrenia research', 'mag_field_of_study': ['Psychology', 'Medicine']}