Regelbundna RNAs spelar viktiga roller i många viktiga biologiska processer, allt från genreglering till proteinsyntes. Detta arbete presenterar en webbaserad verktyg, RNALogo, för att skapa en ny grafisk representation av mönstren i en multipel RNA-sekvens anpassning med en konsensus struktur. RNALogo-grafen kan indikera signifikanta egenskaper inom en RNA-sekvensjustering och dess samsyn RNA sekundär struktur. RNALogo utökar Sequence logos, och specifikt införlivar RNA sekundära strukturer och ömsesidig information av bas-parade regioner i den grafiska representationen. Varje RNALogo graf består av staplar av bokstäver, med en stack för varje position i konsensus RNA sekundär struktur. RNALogo ger en bekväm och hög konfigurerbar logo generator. En RNALogo-graf genereras för varje RNA-familj i Rfam, och dessa genererade logotyper ackumuleras i ett galleri av RNALogo. Användare kan söka eller bläddra RNALogo grafer i detta galleri för att få ytterligare perspektiv av kända RNA familjer. RNALogo finns nu tillgänglig på http://rnalogo. mbc.nctu.edu.tw/.
RNALogo utökar sekvens logos, och specifikt införlivar RNA sekundära strukturer och ömsesidig information om bas-parade regioner i den grafiska representation REF.
RNALogo: a new approach to display structural RNA alignment
{'venue': 'Nucleic Acids Research', 'journal': 'Nucleic Acids Research', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine', 'Computer Science']}