Motivering: Det finns flera nivåer av osäkerhet som är involverade i matematisk modellering av biokemiska system. Det kan ofta finnas en viss osäkerhet om värdena för kinetiska parametrar, om modellens allmänna struktur och om biokemiska arters beteende som inte kan observeras direkt. Metoderna för Bayesian inference ger en konsekvent ram för modellering och förutsägelse i dessa osäkra förhållanden. Vi presenterar ett programvarupaket för att tillämpa Bayesian inferential metodik för problem inom systembiologi. Resultat: Beskrivs här är ett programvarupaket, BioBayes, som ger en ram för Bayesian parameteruppskattning och bevismodell rankning över modeller av biokemiska system definierade med hjälp av vanliga differentialekvationer. Paketet är extensibelt så att ytterligare moduler kan inkluderas av utvecklare. Det finns inga andra sådana paket tillgängliga som tillhandahåller denna funktionalitet.
BioBayes REF ) är ett programvarupaket som ger ett ramverk för Bayesian parameteruppskattning av biokemiska system och bevismodell rankning över modeller av biokemiska system definierade med ODE-modeller.
BioBayes: A software package for Bayesian inference in systems biology
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}