Att manuellt kurera kunskap från biomedicinsk litteratur till strukturerade databaser är mycket dyrt och tidskrävande, vilket gör det svårt att hålla jämna steg med den snabba tillväxten av litteraturen. Det finns därför ett trängande behov av att hjälpa biokurering med automatiserade textbrytningsverktyg. Här beskriver vi PubTator, ett webbaserat system för att assistera biokurering. PubTator skiljer sig från de få befintliga verktygen genom att ha ett PubMed-liknande gränssnitt, som många biokuratorer känner igen, och utrustas med flera utmanande textbrytningsalgoritmer för att säkerställa kvaliteten på sina automatiska resultat. Genom en formell utvärdering med två externa användargrupper visade sig PubTator kunna förbättra både den manuella kureringens effektivitet och noggrannhet. PubTator är offentligt tillgänglig på http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ CBBresearch/Lu/Demo/PubTator/.
Till exempel har Wei et al utvecklat PubTator, ett PubMed ersättningsgränssnitt som använder flera textbrytningsalgoritmer för att förbättra sökresultat REF.
PubTator: a web-based text mining tool for assisting biocuration
{'venue': 'Nucleic Acids Research', 'journal': 'Nucleic Acids Research', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine', 'Computer Science']}