Abstract-Biosimulation forskare använder en mängd olika modeller, verktyg och språk för att fånga och bearbeta olika aspekter av biologiska processer. Nuvarande modelleringsmetoder fångar dock inte de underliggande semantiken i biosimuleringsmodellerna tillräckligt för att stödja uppbyggnad, återanvändning, sammansättning och sammanslagning av komplexa biosimuleringsmodeller som härrör från olika experiment. I denna uppsats föreslår vi en ontologibaserad och flerskiktsbaserad biosimuleringsmodell för att underlätta för forskare att dela, integrera och samarbeta med sina kunskapsbaser på webbskalan. I synnerhet undersöker vi den semantiska biosimuleringsmodellen inom ramen för den flerskaliga finita elementmodellen (FE) av det inre örat. Den föreslagna ontologibaserade biosimuleringsmodellen kommer att ge en homogeniserad och standardiserad tillgång till de gemensamma, semantiskt integrerade och harmoniserade datauppsättningarna för kliniska data (histoologiska data, mikro-CT-bilder av snäckan, patologiska data) och modeller för FE-simulering i innerörat. Det arbete som presenteras i detta dokument analyseras och utformas som en del av EU-projektet SIFEM.
På samma sätt har SIFEM-konsortiet utvecklat en ontologisk flerskalig modell av den mänskliga snäckan (iner-ear) REF.
Towards a semantic representation for multi-scale finite element biosimulation experiments
{'venue': '13th IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering', 'journal': '13th IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering', 'mag_field_of_study': ['Computer Science']}