Bakgrund: Signal-till-buller-Ratio (SNR) används ofta för identifiering av biomarkörer för två klasser problem och ingen formell och användbar generalisering av SNR finns tillgänglig för flerklass problem. Vi föreslår innovativa generaliseringar av SNR för cancerdiskriminering i flera klasser genom införande av två index, Gene Dominant Index och Gene Dormant Index (GDI). Dessa två index leder till begreppen dominerande och vilande gener med biologisk betydelse. Vi använder dessa index för att utveckla metoder för upptäckt av dominerande och vilande biomarkörer med intressant biologisk betydelse. Dominansen och dvalan hos de identifierade biomarkörerna och deras utmärkta särskiljande kraft demonstreras också bildligt med hjälp av spridningsplot av individuell gen och 2-D Sammons projicering av den valda uppsättningen gener. Med hjälp av information från litteraturen har vi visat att den GDI-baserade metoden kan identifiera dominanta och vilande gener som spelar en betydande roll i cancerbiologin. Dessa biomarkörer används också för att konstruera diagnostiska förutsägelsesystem.
Tsai m.fl. I REF föreslogs en innovativ generalisering av signal-till-brus-förhållandet (SNR) för klassificering av cancer i flera klasser.
Discovery of dominant and dormant genes from expression data using a novel generalization of SNR for multi-class problems
{'venue': 'BMC Bioinformatics', 'journal': 'BMC Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}