Bakgrund: DNA-metylering spelar en nyckelroll i utvecklingsprocesser, vilket återspeglas i att förändra metyleringsmönster vid specifika CpG-platser under en individs livstid. De underliggande mekanismerna är komplexa och kan eventuellt påverka flera gener eller hela vägar. Resultat: Vi tillämpade ett multivariat tillvägagångssätt för att identifiera kombinationer av CpG platser som genomgår ändringar vid övergång mellan utvecklingsstadier. Monte Carlo-funktionens urval resulterade i en lista över rangordnade och statistiskt signifikanta CpG-platser, medan regelbaserade modeller tillät identifiering av särskilda metyleringsförändringar på dessa platser. Vår regelbaserade klassificering rapporterar kombinationer av CpG platser, tillsammans med förändringar i deras metylering status i form av lättlästa IF-THEN regler, som gör det möjligt att identifiera de gener som är förknippade med de underliggande platserna.
Moghadam m.fl. I REF föreslogs en regelbaserad klassificering för att rapportera kombinationer av CpG-platser för att identifiera särskilda metyleringsförändringar på dessa platser.
Combinatorial identification of DNA methylation patterns over age in the human brain
{'venue': 'BMC Bioinformatics', 'journal': 'BMC Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine', 'Computer Science']}