Vi rapporterar utgivningen av PredictProtein för Debians operativsystem och derivat, såsom Ubuntu, Bio-Linux och Cloud BioLinux. PredictProtein-sviten är tillgänglig som en standarduppsättning Debianpaket med öppen källkod. Utgivningen täcker de mest populära prediktionsmetoderna från Rost Lab, inklusive metoder för förutsägelse av sekundär struktur och lösningsmedelstillgänglighet (proffd), kärnlokaliseringssignaler (predictnls), och i sig oordnade regioner (norsnet). Vi presenterar också två fallstudier som framgångsrikt använder PredictProtein-paket för högpresterande datorsystem i molnet: den första analyserar proteinstörning för hela organismer, och den andra analyserar effekten av alla möjliga enstaka sekvensvarianter i proteinkodningsområden i det mänskliga genomet.
Den utgåva av Cloud BioLinux som rapporteras i REF består av den redan nämnda PredictProtein-sviten som innehåller metoder för förutsägelse av sekundär struktur och lösningsmedelstillgänglighet (proffd), kärnlokaliseringssignaler (predictnls) och i sig oordnade regioner (norsnet).
Cloud Prediction of Protein Structure and Function with PredictProtein for Debian
{'venue': 'BioMed Research International', 'journal': 'BioMed Research International', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}