System som extraherar strukturerad information från naturliga språk passager har varit mycket framgångsrika inom specialiserade domäner. Tiden är lämplig för att utveckla analoga tillämpningar för molekylärbiologi och genomik. Vi presenterar ett system, GENIES, som extraherar och strukturerar information om cellvägar från den biologiska litteraturen i enlighet med en kunskapsmodell som vi utvecklat tidigare. Vi implementerade GENIES genom att modifiera ett befintligt medicinskt naturligt språkbehandlingssystem, MedLEE, och genomförde en preliminär utvärderingsstudie. Våra resultat visar värdet av de underliggande teknikerna i syfte att förvärva värdefull kunskap från biologiska tidskrifter. Kontaktuppgifter:
Friedman m.fl. REF har utvecklat ett liknande system för att extrahera strukturinformation om cellulära banor med hjälp av en kunskapsmodell.
GENIES : a natural-language processing system for the extraction of molecular pathways from journal articles
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}