Abstract På sin väg till synapsen och tillbaka, neuronala proteiner transporteras i last vesiklarna längs axoner och dendriter. Här visar vi att de viktigaste parametrarna för axonal transport, d.v.s., partikelhastigheter och paustider kan läsas ut från CCD-kamera bilder automatiskt. I den aktuella studien uppnås detta genom kors- och autokorrelering av kymografkolonner. Metodens tillämplighet mättes på simulerade kymografer och data från axonala transporttider för mRPP-märkt synaptofysin. Vid jämförelse av resultat av hastighetsbestämningar via en prestandaparameter som är jämförbar med definitionen av signal-till-brus-förhållande (SNR), finner vi att resultaten är beroende av provtagning, partikelantal och signal till buller från kymografen. Autokorrelering av enskilda kolumner möjliggör exakt bestämning av uppehåll tidspopulationer. I motsats till manuell spårning, kräver korrelation inte erfarenhet, a priori antaganden eller disentangling av enskilda partikelbanor och kan fungera vid låg SNR.
Welzel m.fl. REF utvärderade axonal transport genom kors- och autokorrelering av kymografkolonner.
Determination of axonal transport velocities via image cross- and autocorrelation
{'venue': 'European Biophysics Journal', 'journal': 'European Biophysics Journal', 'mag_field_of_study': ['Chemistry', 'Medicine']}