Sammanfattning av denna webbsida: Detta dokument ger en specifikation och en första validering av en utvärderingsram för jämförelse av förlustkompressorer av genomsekvenseringskvalitetsvärden. Målet är att definiera referensdata, testuppsättningar, verktyg och mätvärden som ska användas för att utvärdera effekten av förlustkompression av kvalitetsvärden på människans genomvariant. Ramverkets funktionalitet är validerad med avseende på två toppmoderna genomkompressorer. Detta arbete har stimulerats av den nuvarande verksamheten inom den tekniska kommittén ISO/IEC SC29/WG11 (alias. MPEG), som undersöker möjligheten att starta en standardiseringsaktivitet för genomisk information representation.
Dessutom föreslog MPEG standardiseringskommittén en ram för utvärdering av effekten av förlust kompressorer på mänskliga genom variant kallar REF, med hjälp av forskare för att uppskatta effekterna av förlust komprimering algoritmer på variant calling.
An Evaluation Framework for Lossy Compression of Genome Sequencing Quality Values
{'venue': '2016 Data Compression Conference (DCC)', 'journal': '2016 Data Compression Conference (DCC)', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}