Interaktionsdetektionsmetoder har lett till upptäckt av tusentals interaktioner mellan proteiner, och urskiljande relevans inom storskaliga datamängder är viktigt för dagens biologi. Här infördes en spektral metod som härleddes från grafteorin för att avslöja dolda topologiska strukturer (dvs. kvasi-kluster och kvasi-bipartiter) från komplicerade nätverk för protein±proteininteraktion. Våra analyser tyder på att dessa dolda topologiska strukturer består av biologiskt relevanta funktionella grupper. Detta resultat motiverar en ny metod för att förutsäga funktionen av okaraktäriserade proteiner baserat på klassi®cation av kända proteiner inom topologiska strukturer. Med hjälp av denna spektralanalysmetod isolerades 48 kvasi-kluster och sex kvasi-bipartiter från ett nätverk som omfattade 11 855 interaktioner mellan 2617 proteiner i knoppande jäst, och 76 okaraktäriserade proteiner tilldelades funktioner.
Bu och al. REF använde spektralklustermetoden för att hitta kvasi-kluster och kvasi-bikliquer från proteininteraktionsnätverk.
Topological structure analysis of the protein–protein interaction network in budding yeast
{'venue': 'Nucleic acids research', 'journal': 'Nucleic acids research', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}