Integrativbiologi (IB) använder experimentell eller beräknings kvantitativ teknik för att karakterisera biologiska system på molekylära, cellulära, vävnads- och populationsnivåer. IB innebär normalt integrering av data, kunskap och kapacitet över disciplinära gränser för att lösa komplexa problem. Vi identifierar en rad bioinformatiska problem som utgörs av tvärvetenskaplig integration: (i) dataintegration som kopplar samman strukturerade data över relaterade biomedicinska domäner; (ii) ontologiintegration som för jargonger, terminologier och taxonomier från olika discipliner till ett enhetligt nätverk av ontologier; (iii) kunskapsintegration som integrerar olika kunskapsfaktorer från flera källor; (iv) tjänsteintegration som bygger applikationer av tjänster som tillhandahålls av olika leverantörer. Vi hävdar att IB kan dra stor nytta av de integrationslösningar som möjliggörs av Semantic Web (SW) teknik. SW gör det möjligt för forskare att dela innehåll utanför gränserna för applikationer och webbplatser, vilket resulterar i en webb av data som är meningsfull och förståelig för alla datorer. I denna översyn ger vi inblick i hur SW-teknik kan användas för att bygga öppna, standardiserade och interoperabla lösningar för tvärvetenskaplig integration på global basis. Vi presenterar en rik uppsättning fallstudier i systembiologi, integrativ neurovetenskap, bio-farmaceutik och translationell medicin, för att belysa de tekniska egenskaperna och fördelarna med SW applikationer i IB.
Numera är semantisk teknik kärnan i många system som stöder dataintensiva forskningsområden, vilket är fallet med systembiologi, integrativ neurovetenskap, biofarmaka och translationell medicin, bara för att nämna några fall REF.
Semantic Web meets Integrative Biology: a survey
{'venue': 'Briefings in bioinformatics', 'journal': 'Briefings in bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}