ABSTRACT Summary: Two Sample Logo är ett webbaserat verktyg som detekterar och visar statistiskt signifikanta skillnader i positionsspecifika symbolsammansättningar mellan två uppsättningar av flera sekvensanpassningar. I ett typiskt scenario kommer två grupper av ordnade sekvenser att dela ett gemensamt motiv men skilja sig åt i sin funktionella annotering. Införandet av bakgrundsjusteringen ger en lämplig underliggande aminosyra- eller nukleotidfördelning och adresserar intersite-symbol korrelationer. Dessutom är skillnaden detektionsprocessen känslig för storleken på de anpassade grupperna. Två Sample Logo förlänga WebLogo, en allmänt använd sekvens logo generator. Källkoden distribueras enligt MIT Open Source-licensavtalet och är tillgänglig för nedladdning utan kostnad.
Två Sample Logo visualiserar de statistiska skillnaderna mellan två uppsättningar av sekvens anpassning genom att använda sekvens logotyper REF.
Two Sample Logo: a graphical representation of the differences between two sets of sequence alignments
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}