Narkotikainteraktioner är en viktig orsak till negativa läkemedelseffekter och ett folkhälsoproblem, eftersom de ökar kostnaderna för sjukhusvård och minskar patienternas livskvalitet. Detektion av DDI är därför ett viktigt mål för patientsäkerheten, ett mål vars strävan påverkar läkemedelsutveckling och säkerhetsövervakning. I den här artikeln beskriver vi ett protokoll som tillämpas i stor skala för att förutsäga nya DDI:er baserat på likheter mellan läkemedelsinteraktionskandidater och läkemedel som är involverade i etablerade DDI:er. Metoden integrerar en referensstandarddatabas över kända DDI med information om läkemedelslikviditet som utvunnits från olika källor, t.ex. 2D- och 3D-molekylstruktur, interaktionsprofil, mål- och sidoeffekter. Metoden kan tolkas på så sätt att den genererar läkemedelsinteraktionskandidater som kan spåras till farmakologiska eller kliniska effekter. Vi beskriver ett protokoll med tillämpningar inom patientsäkerhet och preklinisk toxicitetsscreening. Tidsramen för att genomföra detta protokoll är 5–7 timmar, med ytterligare tid som kan behövas, beroende på komplexiteten i referensstandarden DDI-databas och de åtgärder för likhet som genomförts.
Vilar m.fl. REF utvecklade en metod baserad på de molekylära strukturella likheterna mellan läkemedel.
Similarity-based modeling in large-scale prediction of drug-drug interactions
{'venue': 'Nature Protocols', 'journal': 'Nature Protocols', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}