Motivering Att omvandla den stora mängden friformatstext som finns i tidskrifter till ett koncist, strukturerat format gör det lättare för forskaren att söka information. Nyligen har flera system för informationsextraktion utvecklats som försöker förenkla insamling och analys av biologiska och medicinska data. Merparten av detta arbete har använt det abstrakta ensam, på grund av bekvämligheten av tillgång och kvaliteten på data. Abstracts är i allmänhet tillgängliga genom centrala samlingar med enkel direkt tillgång (t.ex. Det är PubMed. De fullständiga dokumenten innehåller mer information, men är fördelade på många platser (t.ex. Förlagswebbplatser, tidskriftswebbplatser och lokala arkiv), vilket försvårar tillgången. I detta dokument presenterar vi BioRAT, ett nytt verktyg för informationsextraktion (IE), speciellt utformat för att utföra biomedicinska IE, och som kan få tillgång till och analysera både abstracts och fullängdspapper. BioRAT är en Biological Research Assistant för Text mining, och innehåller en dokumentsökning förmåga med domän specifika IE. Resultat Vi visar först, att BioRAT utför såväl som befintliga system, när de tillämpas på abstracts; och för det andra, att betydligt mer information är tillgänglig för BioRAT genom fullängdspapper än enbart via abstracts. Vanligtvis utvinns mindre än hälften av den tillgängliga informationen ur det abstrakta, där majoriteten kommer från varje papper. Totalt uppnådde BioRAT 39% recall med 48% precision. Tillgänglighet: Programvaran kan laddas ner från
REF fann att mer än hälften av informationen om proteinproteininteraktioner i artiklar finns i kroppen.
BioRAT: Extracting Biological Information from Full-length Papers
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}