Uppgiften Entity Linking (EL) länkar samman en enhet som från ett ostrukturerat dokument nämner till en enhet i en kunskapsbas. Även om detta problem är välstuderat i nyheter och sociala medier, har detta problem inte fått mycket uppmärksamhet inom life science-området. Ett resultat av att ta itu med EL-problemet inom biovetenskapsområdet är att göra det möjligt för forskare att bygga beräkningsmodeller för biologiska processer med större effektivitet. Att helt enkelt tillämpa en nyhetsutbildad enhet länkare ger dock otillräckliga resultat. Eftersom befintliga övervakade metoder kräver en stor mängd manuellt märkta utbildningsdata, som för närvarande inte finns tillgängliga för life science-domänen, föreslår vi en ny oövervakad kollektiv slutledningsmetod för att länka samman enheter från ostrukturerade fullständiga texter av biomedicinsk litteratur till 300 ontologier. Metoden utnyttjar den rika semantiska informationen och strukturerna i ontologier för likhetsberäkning och rankning av företag. Utan att använda någon manuell anmärkning överträffar vårt tillvägagångssätt betydligt den toppmoderna övervakade EL-metoden (9 % absolut vinst när det gäller att länka samman noggrannhet). Dessutom kräver den toppmoderna övervakade EL-metoden 15 000 manuellt anmälda enheter som nämns för utbildning. Dessa lovande resultat fastställer ett riktmärke för EL-uppgiften inom området för biovetenskap1. Vi tillhandahåller även djupanalys och diskussion om både utmaningar och möjligheter för automatisk kunskapsberikning för vetenskaplig litteratur. I detta dokument föreslår vi en ny, oövervakad, kollektiv slutsats för att ta itu med problemet med EL på ett nytt område. Vi visar att vår oövervakade strategi kan överträffa en aktuell toppmodernt övervakad strategi som har utbildats med en stor mängd manuellt märkta data. Life science presenterar en underrepresenterad do- * Dessa författare bidrog lika till utarbetandet av detta manuskript. Europaparlamentets och rådets förordning (EU, Euratom) nr 966/2012 av den 25 oktober 2012 om finansiella regler för unionens allmänna budget och om upphävande av rådets förordning (EG, Euratom) nr 1605/2002 (EUT L 298, 26.10.2012, s. 1). huvudsaklig användning av EL-teknik. Genom att tillhandahålla en liten uppsättning referensdata och identifiera möjligheter hoppas vi kunna stimulera diskussioner kring behandling av naturligt språk och bioinformatik och motivera andra att utveckla tekniker för denna i stort sett outnyttjade domän.
Zheng m.fl. föreslog en kollektiv slutsatssmetod som utnyttjar semantisk information och strukturer inom ontologi för att lösa den enhet som kopplar samman problem för biomedicinsk litteratur REF.
Entity Linking for Biomedical Literature
{'venue': "DTMBIO '14", 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science']}