Ett nytt system för att anpassa hela genomsekvenser beskrivs. Med hjälp av en effektiv datastruktur som kallas suffixträd kan systemet snabbt anpassa sekvenser som innehåller miljontals nukleotider. Dess användning visas på två stammar av Mycobacterium tuberculos, på två mindre liknande arter av Mycoplasma bakterier och på två synteniska sekvenser från human kromosom 12 och muskromosom 6. I varje fall fann den en justering av ingångssekvenserna, med hjälp av mellan 30 s och 2 min beräkningstid. Från systemutgången kan information om enstaka nukleotidförändringar, translokationer och homologa gener enkelt extraheras. Användningen av algoritmen bör underlätta analys av synteniska kromosomer, jämförelser mellan stammar, evolutionära jämförelser och genomiska dubbleringar.
I REF föreslog författarna ett system för att anpassa och jämföra hela genom som kallas "MUMMER".
Alignment of whole genomes
{'venue': 'Nucleic Acids Res', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}