Vi beskriver ett grafiskt anatomiskt databasprogram, kallat XANAT (så namngivet eftersom det utvecklades under X-fönstersystemet i UNIX), som gör det möjligt att lagra, jämföra och analysera resultaten av många studier om neuroanatomiska anslutningar i ett standardiserat format. Data förs in i databasen genom att man ritar in injektions- och märkningsplatser från en viss spårämnesstudie direkt på kanoniska representationer av de neuroanatomiska strukturer som är av intresse, tillsammans med beskrivande textinformation. Sökningar kan sedan utföras på data genom att fråga databasen grafiskt, till exempel genom att ange en region av intresse inom hjärnan för vilken anslutningsinformation önskas, eller via textinformation, såsom nyckelord som beskriver en viss hjärnregion, eller en författare namn eller referens. Analyser kan också utföras genom att samla data över flera studier och visa en färgkodad karta som grafiskt representerar det totala beviset för anslutning mellan regioner. Således, data kan studeras och jämföras fri från areal gränser (som ofta varierar från en laborator y till nästa), och i stället med avseende på standard landmärken, såsom positionen i förhållande till välkända neuroanatomiska substrat eller stereotaxiska koordinater. Om så önskas, kan områdesgränser också avväpnas av användaren för att underlätta tolkningen av resultaten. Vi demonstrerar tillämpningen av databasen på analysen av pulvinar ^kortical anslutningar i macaque apa, för vilken resultaten av över 120 neuroanatomical experiment fördes in i databasen. Vi visar hur dessa tekniker kan användas för att belysa konnektivitet trender och mönster som annars kan gå obemärkt.
Direkt sökning genom att rita regioner av intresse för en 2D-bild för att fråga injicering och etikett platser på en uppsättning relaterade studier har realiserats av Press et al. REF som gränssnitt till XANAT-databasen.
A Graphical Anatomical Database of Neural Connectivity
{'venue': 'Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences', 'journal': 'Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}