Bakgrund: Bred spridning av höggenomströmningssekvensering har avsevärt ökat omfattningen och förfiningen av den beräkningsinfrastruktur som behövs för att utföra genomisk forskning. Ett alternativ till att bygga och underhålla lokal infrastruktur är "cloud computing", som i princip ger tillgång till flexibel beräkningsinfrastruktur på begäran. Men cloud computing resurser är ännu inte lämpliga för omedelbar "som är" användning av experimentella biologer. Vi presenterar ett molnresurshanteringssystem som gör det möjligt för enskilda forskare att komponera och kontrollera ett godtyckligt storleksanpassat kluster på Amazons EC2-molninfrastruktur utan några informatikkrav. Inom detta system finns en hel uppsättning biologiska verktyg förpackade av NERC Bio-Linux-teamet (http://nebc.nerc.ac.uk/tools/bio-linux) tillgängliga för omedelbar konsumtion. Den medföljande lösningen gör det möjligt, med bara en webbläsare, att skapa en helt konfigurerad datorkluster redo att utföra analys på mindre än fem minuter. Dessutom tillhandahåller vi en automatiserad metod för att bygga anpassade distributioner av molnresurser. Detta tillvägagångssätt främjar reproducerbarheten av resultat och, om så önskas, tillåter individer och labb att lägga till eller anpassa ett annars tillgängligt molnsystem för att bättre möta deras behov. Den förväntade kunskapen och tillhörande ansträngningar med att distribuera en compute kluster i Amazon EC2 molnet är inte trivialt. Den lösning som presenteras i detta dokument eliminerar dessa hinder, vilket gör det möjligt för forskare att distribuera exakt den mängd datorkraft de behöver, i kombination med en mängd befintliga analysprogram, för att hantera den pågående data översvämningen.
Det mest liknande arbetet med vår strategi är CloudMan REF, ett molnresurshanteringssystem för enskilda forskare att distribuera en Galaxy instans på EC2.
Galaxy CloudMan: delivering cloud compute clusters
{'venue': 'BMC Bioinformatics', 'journal': 'BMC Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}