Biologer behöver ofta hitta information om gener vars funktion inte beskrivs i genomdatabaserna. För närvarande måste de försöka söka efter olika biomedicinsk litteratur för att hitta relevanta artiklar, och ägna betydande ansträngningar åt att läsa de hämtade artiklarna för att hitta de mest relevanta kunskaperna om genen. Vi beskriver vår programvara, den första som automatiskt genererar gensammanfattningar från biomedicinsk litteratur. Vi presenterar en två-steg summering metod, som innebär att först hämta relevanta artiklar och sedan extrahera de mest informativa meningar från de hämtade artiklarna för att generera en strukturerad gensammanfattning. Den genererade sammanfattningen täcker uttryckligen flera aspekter av en gen, såsom sekvensinformation, muterade fenotyper och molekylär interaktion med andra gener. Vi föreslår flera heuristiska metoder för att förbättra noggrannheten i båda stadierna. De föreslagna metoderna utvärderas med hjälp av 10 slumpmässigt utvalda gener från FlyBase och en delmängd av Medline abstracts om Drosophila. Resultaten visar att precisionen i de högst valda meningarna i de 6 aspekterna vanligtvis är omkring 50-70%, och de genererade sammanfattningarna är ganska informativa, vilket tyder på att våra metoder är effektiva i att automatiskt sammanfatta litteraturinformation om gener. De framtagna sammanfattningarna är inte bara direkt användbara för biologer utan fungerar också som användbara ingångspunkter för att de snabbt ska kunna smälta de återvunna litteraturartiklarna.
Ling m.fl. REF presenterade ett system för automatisk gensammanfattning som konstruerar en sammanfattning baserad på sex aspekter av en gen, såsom genprodukter, mutant fenotyp, etc.
Automatically Generating Gene Summaries from Biomedical Literature
{'venue': 'Pacific Symposium on Biocomputing', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}