Felkorrigering av sekvenserade avläsningar är fortfarande en svår uppgift, särskilt i encellssekvenseringsprojekt med extremt icke-uniform täckning. Medan befintliga felkorrigeringsverktyg utformade för standard (multicell) sekvenseringsdata vanligtvis kommer upp i encellssekvensering projekt, algoritmer som faktiskt används för encellsfelkorrigering har hittills varit mycket förenklad. Vi introducerar flera nya algoritmer baserade på hamming grafer och Bayesian subclustering i vårt nya felkorrigeringsverktyg BayesHammer. Medan BayesHammer var utformad för encellssekvensering, visar vi att den också förbättrar befintliga felkorrigeringsverktyg för flercellssekvensering av data samtidigt som den arbetar mycket snabbare på verkliga datauppsättningar. Vi jämför BayesHammer på både k-mer räkningar och faktiska monteringsresultat med SPADES genommonterare.
Nikolenko m.fl. införde en ny algoritm baserad på hamming grafer och bayesian sub-clustering för felkorrigering i singlecell sekvensing data REF.
BayesHammer: Bayesian clustering for error correction in single-cell sequencing
{'venue': 'BMC Genomics 14(Suppl 1) (2013), pp. S7', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine', 'Computer Science']}