Bakgrund: Läkemedelsinteraktioner rapporteras ofta i den ökande mängden biomedicinsk litteratur. Informationsextraktionsteknik (IE) har utformats som ett användbart instrument för att hantera denna kunskap. Inte desto mindre har IE på meningsnivå en begränsad effekt på grund av de ofta förekommande hänvisningarna till tidigare enheter i diskursen, ett fenomen som kallas "anaphora". DrugNerAR, ett system för anaphoraupplösning, presenteras för att ta itu med problemet med samtidiga uttryck i farmakologisk litteratur. Denna utveckling är en del av en större och innovativ studie om automatisk läkemedelsinteraktion. Systemet använder en uppsättning språkliga regler som dras av Centering Theory över den analys som tillhandahålls av en biomedicinsk syntaktisk tolk. Semantisk information som tillhandahålls av det enhetliga medicinska språksystemet (UMLS) är också integrerad för att förbättra igenkännandet och upplösningen av nominella läkemedelsanaforer. Dessutom har en corpus utvecklats för att analysera fenomenen och utvärdera den nuvarande metoden. Varje möjligt fall av anaforiskt uttryck undersöktes för att avgöra det mest effektiva sättet att lösa problemet. Resultat: Ett F-poäng på 0,76 i anaforaupplösning uppnåddes, vilket var betydligt bättre än utgångsvärdet med nästan 73 %. Denna ad hoc-referenslinje utvecklades för att kontrollera resultaten eftersom det inte finns något tidigare arbete med anaforaupplösning i farmakologiska dokument. De erhållna resultaten liknar de som finns i relaterade-semantiska domäner. Slutsatser: Den nuvarande metoden visar mycket lovande resultat i utmaningen att redovisa anaforiska uttryck i farmakologiska texter. DrugNerAr får liknande resultat som andra tillvägagångssätt som handlar om anaphora upplösning inom den biomedicinska domänen, men, till skillnad från dessa tillvägagångssätt, fokuserar den på dokument som återspeglar läkemedelsinteraktioner. Den centrerande teorin har visat sig vara effektiv vid valet av föregångare i anaphora-upplösning. En viktig komponent i framgången för detta ramverk är den analys som tillhandahålls av MMTx-programmet och DrugNer-systemet som gör det möjligt att hantera komplexiteten i det farmakologiska språket. Det förväntas att de positiva resultaten av resolver ökar prestandan i vårt framtida system för läkemedelsinteraktion. Segura-Bedmar et al. BMC Bioinformatik 2010, 11(Suppl 2):S1
Till exempel Segura-Bedmar et al. REF rapporterade en corpus av 49 läkemedelsinteraktion dokument kommenterade med pronominella och nominella anaphora relationer (DrugNerAR).
Resolving anaphoras for the extraction of drug-drug interactions in pharmacological documents
{'venue': 'BMC Bioinformatics', 'journal': 'BMC Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Computer Science']}