ABSTRACT Under nästa fas av Human Genome Project kommer forskningen att fokusera på funktionella studier av att tilldela funktioner till gener, deras regulatoriska element och andra DNA-sekvenser. För att underlätta användningen av genomisk information i sådana studier krävs ett nytt modelleringsperspektiv för att undersöka och studera genomsekvenser i samband med många typer av biologisk information. Vägar är det logiska formatet för modellering och presentation av sådan information på ett sätt som är bekant för biologiska forskare. Resultat: I det här dokumentet presenterar vi ett integrerat system, Pathways Database System, med en uppsättning programvara verktyg för modellering, lagring, analys, visualisering, och ifrågasätta biologiska vägar data på olika nivåer av genetisk, molekylär, biokemisk och organismal detalj. De nya funktionerna i systemet inkluderar: a) genomisk information integrerad med andra biologiska data och presenteras från en väg, snarare än från DNA-sekvens, perspektiv, b) design för biologer som möjligen är obekanta med genomik, men vars forskning är nödvändig för att kommentera gen- och genomsekvenser med biologiska funktioner, c) databasdesign, implementation och grafiska verktyg som gör det möjligt för användare att visualisera banor data i flera abstraktionsnivåer, och att posera förutbestämda frågor, och d) en implementation som möjliggör web (XML)-baserad spridning av frågeutgångar (dvs. banor data) till forskare i samhället, ger dem kontroll över användningen av banor data.
Bandatabassystemet REF ) är ett komplett system för modellering, visualisering och redigering banor.
Pathways database system: an integrated system for biological pathways
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}