Motivering: På grund av det ökande antalet molekylärbiologiska databaser och den exponentiella tillväxten av deras innehåll är databasintegration ett viktigt ämne inom bioinformatik. Befintliga strategier på detta område har gemensamt att det krävs betydande insatser för att ge integrerad tillgång till heterogena datakällor. Resultat: I den här artikeln beskrivs LIMBO-arkitekturen som en lättviktsstrategi för molekylär biologisk databasintegration. Genom att bygga system på denna arkitektur kan de insatser som krävs för integrering av databaser minskas avsevärt. Tillgänglighet: Som en illustration av den principiella nyttan av de underliggande idéerna beskrivs ett prototypiskt genomförande baserat på LIMBO-arkitekturen. Denna implementation baseras uteslutande på fritt tillgängliga öppenkällkodskomponenter som PostgreSQL databashanteringssystem och BioRuby-projektet. Ytterligare filer och modifierade komponenter finns tillgängliga på begäran av författaren.
För att minska belastningen på databasintegrationen är LIMBO-arkitekturen i REF utformad som en lättviktsstrategi för att lösa problemen med ständigt växande datalagringsschema.
Light-weight integration of molecular biological databases
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}