Abstract-Genetisk information ökar exponentiellt och fördubblas var artonde månad. Att analysera denna information inom rimlig tid kräver parallella datorresurser. Även om betydande forskning har behandlat DNA-analys med hjälp av GPUs, hittills inte mycket uppmärksamhet har ägnats Intel Xeon Phi coprocessor. I detta papper presenterar vi en algoritm för storskalig DNA-analys som utnyttjar tråd-nivå och SIMD parallellism Intel Xeon Phi. Vi utvärderar vår strategi för olika antal kärnor och tråd allokering affiniteter i samband med verkliga DNA-sekvenser av mus, katt, hund, kyckling, människa och kalkon. De experimentella resultaten på Intel Xeon Phi visar upphastigheter på upp till 10× jämfört med en sekventiell implementation som körs på en Intel Xeon processor E5.
Paper REF presenterar en algoritm för storskalig DNA-analys för olika antal kärnor och trådaffiniteter.
Accelerating DNA Sequence Analysis Using Intel(R) Xeon Phi(TM)
{'venue': '2015 IEEE Trustcom/BigDataSE/ISPA', 'journal': '2015 IEEE Trustcom/BigDataSE/ISPA', 'mag_field_of_study': ['Computer Science']}