Vi beskriver methclone, en ny metod för att identifiera epigenetisk loci som hyser stora förändringar i kloniteten hos deras epialleler (epigenetiska alleler). Methclone analyserar effektivt genom-omfattande DNA-metyleringssekvensdata. Vi kvantifierar förändringarna med hjälp av en sammansättning entropi skillnad beräkning och även införa ett nytt mått på global klonality skifte, loci med epiallele skift per miljon loci täckt, vilket möjliggör jämförelser mellan olika prover för att mäta den totala epialleliska dynamiken. Slutligen visar vi nyttan av methclone för att fånga funktionella epiallel förändringar hos leukemipatienter från diagnos till återfall. Methclone är öppen källkod och fritt tillgänglig på
Författarna till REF jämför epialleldistributionen i två sjukdomsstadier med hjälp av en beräkning av "kompositionsentropiskillnaden".
Dynamic evolution of clonal epialleles revealed by methclone
{'venue': 'Genome Biology', 'journal': 'Genome Biology', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}