Begreppet robusta regleringsnät har fått stor uppmärksamhet under det senaste årtiondet. Ett mått på robusthet har förknippats med volymen i den genomförbara regionen, nämligen regionen i det parameterutrymme där systemet är funktionellt. I detta dokument visar vi att förutom volymen har geometrin i denna region viktiga konsekvenser för ett nätverks robusthet och bräcklighet. Vi utvecklar en approximation inom vilken vi algebraiskt kan specificera den genomförbara regionen. Vi analyserar segmentet polaritet gennätverk för att illustrera vår strategi. Studien av slumpmässiga promenader i parameterutrymmet och hur de lämnar den genomförbara regionen ger oss ett rikt perspektiv på de olika sätten att misslyckas i denna nätverksmodell. I synnerhet fann vi att mellan två alternativa sätt att aktivera Wingless, en är mer robust än den andra. Vår metod ger ett mer komplett mått på robusthet till parametervariation. Som en allmän modellstrategi är vårt tillvägagångssätt ett intressant alternativ till Boolesk representation av biokemiska nätverk.
När det gäller robusthet föreslår Chaves och kollegor i REF ett kvantitativt mått på robusthet som motsvarar volymen av uppsättningen giltiga parametrar i parameterutrymmet.
Shape, Size, and Robustness: Feasible Regions in the Parameter Space of Biochemical Networks
{'venue': 'PLoS Computational Biology', 'journal': 'PLoS Computational Biology', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine', 'Computer Science']}