Upptäckten av biologiska relationer mellan gener är en av nycklarna till att förstå den komplexa funktionella naturen hos det mänskliga genomet. För närvarande finns de flesta av kunskaperna om interrelaterande gener i enorma mängder av olika biomedicinsk litteratur. Därför utgör utvinning av biologiska sammanhang som förekommer i fri text ett värdefullt verktyg för att få kunskap om geninteraktioner. Vi presenterar en textanalys av dokument associerade med par av gener, och beskriver hur detta tillvägagångssätt kan användas för att upptäcka och kommentera funktionella relationer mellan gener. En studie på en delmängd av mänskliga gener visar att vårt analysverktyg kan fungera som en rankningsmekanism för uppsättningar av gener baserat på deras funktionella relationsförmåga.
I sitt arbete beskrev Nakken Ref en metod för textanalys baserad på global och lokal analys av dokument associerade med par av gener och illustrerar hur deras tillvägagångssätt kan användas för att upptäcka, identifiera och kommentera funktionella relationer mellan dem.
Finding Functionally Related Genes by Local and Global Analysis of Medline Abstracts
{'venue': 'of MEDLINE abstracts”, SIGIR04 Bio Workshop: Search and Discovery in Bioinformatics', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Biology']}