En betydande del av den biomedicinska litteraturen representeras på ett sätt som gör det svårt för konsumenterna att hitta eller aggregera innehåll genom en beräkningsfråga. En metod för att underlätta återanvändning av den vetenskapliga litteraturen är att strukturera denna information som länkad data med hjälp av standardiserad webbteknik. I detta dokument presenterar vi den andra versionen av Biotea, en semantisk, länkad dataversion av den open-access delmängd av PubMed Central som har förbättrats med specialiserade annotationspipelines som använder befintlig infrastruktur från National Center for Biomedical Ontology. Vi exponerar våra modeller, tjänster, mjukvara och dataset. Vår infrastruktur möjliggör manuell och halvautomatisk annotering, resulterande data representeras som RDF-baserade länkade data och kan enkelt frågas med hjälp av SPARQL frågespråk. Vi illustrerar nyttan av vårt system med flera användningsfall. Våra datauppsättningar, metoder och tekniker finns tillgängliga på http://biotea.github.io.
Biotea (https ://biote a.githu b.io) REF ) är en RDF-datauppsättning som innehåller information om några av de artiklar som finns i undergruppen Open Access av PubMed Central, som har förbättrats med specialiserade annoteringsrörledningar.
Biotea: semantics for Pubmed Central
{'venue': 'PeerJ', 'journal': 'PeerJ', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}