Abstract-För att stödja storskaliga biomedicinska forskningsprojekt, behöver organisationer dela personspecifika genomiska sekvenser utan att kränka integriteten hos sina registrerade. Tidigare skyddade organisationer individers identiteter genom att ta bort identifierare, såsom namn och personnummer, men nyligen genomförda undersökningar visar att avidentifierade genomiska data kan "återidentifieras" till namngivna individer med hjälp av enkla automatiserade metoder. I detta dokument presenterar vi ett nytt kryptografiskt ramverk som gör det möjligt för organisationer att stödja genomisk datautvinning utan att avslöja de råa genomiska sekvenserna. Organisationer bidrar med krypterade genomiska sekvensposter till ett centraliserat arkiv, där administratören kan utföra frågor, såsom frekvensräkningar, utan att dekryptera data. Vi utvärderar effektiviteten i vårt ramverk med befintliga databaser av enstaka nucleotide polymorphism (SNP) sekvenser och visar att den tid som behövs för att slutföra räkna frågor är möjlig för verkliga tillämpningar. Till exempel, våra experiment visar att en räkning fråga över 40 SNPs i en databas med 5000 poster kan slutföras i cirka 30 minuter med off-the-shälf-teknik. Vi visar vidare att approximationsstrategier kan tillämpas för att avsevärt påskynda frågeutförandetider med minimal förlust i noggrannhet. Ramen kan genomföras utöver befintlig information och nätverksteknik i biomedicinska miljöer.
Kantarcioglu et al. REF föreslår användning av homomorphic kryptering för att lagra krypterade genomic sekvensposter i ett centraliserat arkiv, så att frågor kan utföras utan dekryptering och därmed utan att bryta deltagarnas integritet.
A Cryptographic Approach to Securely Share and Query Genomic Sequences
{'venue': 'IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine', 'journal': 'IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}