Multipel sekvensjustering (MSA) är ett av de mest användbara verktygen inom bioinformatik. MSA spelar en nyckelroll i protein/RNA strukturförutsägelse, fylogenetisk analys eller mönsteridentifiering bland andra viktiga bioinformatiska tillämpningar. Tillväxten av datasekvenser medför dock ytterligare svårigheter att anpassa den till traditionella verktyg. För storskaliga anpassningar med tusentals sekvenser eller till och med hela genom, kommer det att vara nödvändigt att använda och dra nytta av högpresterande dator (HPC). Detta dokument, som fokuserar på ett konsekvent MSA-verktyg som kallas T-Coffee, presenterar flera innovativa lösningar; Balanced Guide Tree, Optimized Library Method och Multiple Tree Alignment. Resultaten från de metoder som presenterats har visat att det är möjligt att förbättra effektiviteten, skalbarheten och noggrannheten.
Högpresterande datorteknik har använts för MSA-verktyg i REF.
High Performance computing improvements on bioinformatics consistency-based multiple sequence alignment tools
{'venue': 'Parallel Comput.', 'journal': 'Parallel Comput.', 'mag_field_of_study': ['Computer Science']}