Den senaste tidens snabba ökning av antalet tillgängliga tredimensionella proteinstrukturer har ytterligare belyst behovet av att förstå sambandet mellan biologisk funktion och struktur. Med hjälp av strukturella klassificeringssystem som SCOP, CATH och DALI är det nu möjligt att utforska globala relationer mellan proteinveck och funktion, något som tidigare var opraktiskt. Resultat: Med hjälp av en relationsdatabas av CATH-data har vi genererat vikfördelningar för godtyckliga val av proteiner automatiskt. Dessa fördelningar har undersökts i ljuset av proteinfunktion och bundit ligand. Olika enzymklasser återspeglas inte tydligt i distributioner av proteinklass och arkitektur, medan typen av bunden ligand har en mycket mer dramatisk effekt. Tillgången till strukturklassificeringsdata har möjliggjort denna nya översiktsanalys. Vi drar slutsatsen att funktionen på toppnivån i klassificeringen av EG-nummerenzymer inte har något samband med vikning, eftersom endast ett fåtal specifika resthalter i själva verket är ansvariga för enzymaktiviteten. Omvänt är vecket mycket närmare relaterat till ligand typ.
I synnerhet har REF studerat sambandet mellan enzymfunktionen och CATH-vecket classi®cation.
Protein folds and functions
{'venue': 'Structure', 'journal': 'Structure', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}