Bakgrund: Behovet av att hantera stora mängder data är en tydlig efterfrågan på laboratorier idag. Användningen av Laboratory Information Management Systems (LIMS) för att uppnå detta växer varje dag. Ett LIMS är ett komplext beräkningssystem som används för att hantera laboratoriedata med betoning på kvalitetssäkring. Flera LIMS är tillgängliga för närvarande. Men de flesta av dem har egen kod och kommersialiseras med en hög kostnad. Dessutom är LIMS, på grund av sin komplexitet, vanligtvis utformade för att uppfylla behoven hos ett slags laboratorium, vilket gör det mycket svårt att återanvända ett LIMS. I detta arbete beskriver vi Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios (SIGLa), en öppen källkod LIMS med ett nytt tillvägagångssätt som gör det möjligt för den att anpassa sin verksamhet och sina processer till olika typer av laboratorier. Resultat: SIGLa innehåller ett arbetsflödeshanteringssystem som gör det möjligt att skapa och hantera anpassade arbetsflöden. För varje nytt laboratorium definieras ett arbetsflöde med dess aktiviteter, regler och förfaranden. Under utförandet, för varje arbetsflöde som skapas, lagras värdena för attribut som definieras i en XPDL-fil (som beskriver arbetsflödet) i SIGLas databas, vilket gör det möjligt att sedan hanteras och hämtas på begäran. Dessa egenskaper ökar systemets flexibilitet och utökar dess användbarhet till att omfatta behoven hos flera typer av laboratorier. För att konstruera de viktigaste funktionerna i SIGLa definierades först ett arbetsflöde för ett proteomiskt laboratorium. För att validera SIGLas förmåga att anpassa sig till flera laboratorier studerar vi processen och behoven hos ett mikroarraylaboratorium och definierar dess arbetsflöde. Detta arbetsflöde har definierats under en period på cirka två veckor, vilket visar verktygets effektivitet och flexibilitet. Slutsatser: Med hjälp av SIGLa har det varit möjligt att konstruera en microarray LIMS på några dagar som illustrerar flexibiliteten och kraften i den föreslagna metoden. Med SIGLas utveckling hoppas vi kunna bidra positivt till hanteringen av komplexa data i laboratoriet genom att hantera de stora mängderna data, garantera att uppgifterna är enhetliga och öka laboratorieproduktiviteten. Vi hoppas också kunna göra det möjligt för laboratorier med små resurser att erbjuda ett system på hög nivå för komplex datahantering.
SIGLa (Systema Integrado de Gerência de Laboratoriós, REF) bygger på ett arbetsflödeshanteringsverktyg som gör det också anpassningsbart till flera användningsområden.
SIGLa: an adaptable LIMS for multiple laboratories
{'venue': 'BMC Genomics', 'journal': 'BMC Genomics', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Computer Science']}