Ett fylogenetiskt träd är en grafisk representation av en evolutionär historia av taxa där bladen motsvarar taxa och icke-blad motsvarar specificeringar. Ett av de viktiga problemen i fylogenetisk analys är att sätta ihop ett globalt fylogenetiskt träd från små fylogenetiska träd, särskilt kvartettträd. Quartet Kompatibilitet är problemet att avgöra om det finns ett fylogenetiskt träd som framkallar en given samling av kvartettträd, och att konstruera ett sådant fylogenetiskt träd om det finns. Det är känt att Quartet Kompatibilitet är NP-hård och att det bara finns några få resultat kända för polynom-tid solvable underklasser. I detta dokument introducerar vi två nya klasser av kvartettsystem, som kallas komplett flerpartikvartettsystem och komplett flerpartikvartettsystem, och presenterar polynomalgoritmer för kvartettens kompatibilitet för dessa system. Vi ser också att kompletta/fullständiga flerpartikvartettsystem naturligt uppstår från en begränsad situation med blockbegränsad mätning. a < l a t e x i t s h a 1 _ b a s e 6 4 = " e w u S P 0 X D U 5 B Q M j D u i I Q L q O I 4 Y k 8 = " > A A A C Z H i c h H L S N A F D 2 N r 1 q r R Z B E E Q s i q t y I 4 L i q u j G Z R + 2 C r W U J I 4 a m i Y h S Q u 1 + A O 6 V V y 4 U h A
Som ett efterföljande arbete med denna artikel har Hirai och Iwamasa REF infört två nya klasser av kvartettsystem, namngivna kompletta flerpartikvartettsystem och fullständiga flerpartikvartettsystem, och visat att kvartettens kompatibilitet för dessa kvartettsystem kan lösas på polynomtid.
Reconstructing phylogenetic tree from multipartite quartet system
{'venue': 'ISAAC 2018', 'journal': 'arXiv: Combinatorics', 'mag_field_of_study': ['Mathematics', 'Computer Science']}