Främjar metylering av missmatchning reparationsgenen spelar en viktig roll i sporadiska mikrosatellit instabilitet (MSI) kolorektalcancer. Men promotormetylering förekommer ofta i proximal koloncancer, och molekylära fenotyper underliggande MSI cancer i distal kolon har inte helt klarlagts. Vårt mål var att klargöra skillnaden mellan MSI- och mikrosatellitstabilitetscancer (MSS) och dessutom att fastställa distinkta egenskaper hos proximala och distala MSI-cancer. Genom DNA-mikroarray analys av 84 cancerformer (33 MSI och 51 MSS), identifierade vi diskriminerande gener (177 sonduppsättningar), som förutspådde MSI status med hög noggrannhet (97,6%). Dessa gener var relaterade till fenotypiska egenskaper hos MSI-cancer. Därefter identifierade vi 24 sonduppsättningar som var olika uttryckta i proximal och distal MSI-cancer. Dessa gener inkluderade promotormetylering-medierade gener, vars uttryck var signifikant nedreglerad i proximal MSI cancer. Bland särskiljande gener mellan MSI och MSS visade nio metyleringsmedierade gener nedreglering vid MSI-cancer. Av dessa visade 7 (77,8 %) nedreglering vid proximal MSI-cancer. Dessutom bekräftade metyleringsspecifik PCR att frekvensen av hMLH1-promotormetylering var signifikant högre vid proximal MSI-cancer (P = 0,0317). Dessa resultat tyder på att det finns en skillnad mellan proximal och distal MSI-cancer vid metylering-medierad påverkan på genljuddämpande. Sammanfattningsvis, med hjälp av DNA microarray, kunde vi skilja MSI och MSS cancer. Vi visade också tydliga egenskaper hos proximala och distala MSI-cancer. Inaktiveringsformen av hMLH skilde sig i sig mellan proximal och distal MSI-cancer. Dessa resultat tyder på att distal MSI cancer utgör en distinkt subgrupp av sporadiska MSI cancer.
En av datamängderna har använts i REF för att klargöra skillnaden mellan mikrosatellitinstabilitet (MSI) och mikrosatellitstabilitetscancer (MSS) och dessutom för att fastställa distinkta egenskaper hos proximal och distal MSI-cancer.
Distal colorectal cancers with microsatellite instability (MSI) display distinct gene expression profiles that are different from proximal MSI cancers.
{'venue': 'Cancer research', 'journal': 'Cancer research', 'mag_field_of_study': ['Biology', 'Medicine']}