Forskning om utvinning av biomedicinska relationer har fått allt större uppmärksamhet på senare tid, med ett stort antal biologiska och kliniska tillämpningar, bland annat inom farmakopenomik, screening av kliniska prövningar och upptäckt av biverkningar. Förmågan att exakt fånga både semantiska och syntaktiska strukturer i text som uttrycker dessa relationer blir allt mer kritisk för att möjliggöra djup förståelse av vetenskapliga artiklar och kliniska berättelser. De gemensamma uppgiftsutmaningarna har organiserats av både bioinformatik och kliniska informatikgrupper för att bedöma och utveckla den toppmoderna forskningen. Betydande framsteg har gjorts inom algoritmutveckling och resursuppbyggnad. I synnerhet grafbaserade metoder överbrygga semantik och syntax, ofta uppnå bästa prestanda i delade uppgifter. Ett antal problem vid gränserna för biomedicinsk relationsextraktion utgör dock fortfarande intressanta utmaningar och ger möjligheter till stora förbättringar och givande forskning. I denna artikel placerar vi biomedicinsk relation utvinning mot bakgrund av dess mångsidiga tillämpningar, presentera en mild introduktion till sin allmänna pipeline och delade resurser, granska den nuvarande state-of-the-art i metodutveckling, diskutera begränsningar och peka ut flera lovande framtida riktningar.
Forskningen, som pågår i utvinningen av biomedicinska relationer, har också fått ökad uppmärksamhet, "med många biologiska och kliniska tillämpningar inklusive de i farmakopenomik, klinisk prövning screening och biverkningsdetektering", som REF beskriver i detalj.
Bridging semantics and syntax with graph algorithms—state-of-the-art of extracting biomedical relations
{'venue': 'Briefings in bioinformatics', 'journal': 'Briefings in bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}