Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH) skapade Beacon-projektet som ett sätt att testa viljan hos datainnehavare att dela genetiska data i den enklaste tekniska kontexten-en fråga om förekomsten av en specificerad nukleotid på en given position i en kromosom. Varje deltagande webbplats (eller "beacon") ansvarar för att säkerställa att genomiska data exponeras genom Beacon tjänsten endast med tillstånd av den person som uppgifterna gäller och i enlighet med GA4GH policy och standarder. Samtidigt erkänna inferensrisker i samband med storskalig dataaggregation, och det faktum att vissa fyrar innehåller känsliga fenotypiska föreningar som ökar integritetsrisken, GA4GH bedömde risken för återidentifiering baserat på binära ja / ingen allel-närvaro frågesvar som godtagbara. Det senaste arbetet visade dock att med tanke på en fyr med specifika egenskaper (inklusive relativt liten provstorlek och en motståndare som har en individs hela genomsekvens) kan individens medlemskap i en fyr härledas genom upprepade frågor om varianter som finns i individens genom. I detta dokument föreslår vi tre praktiska strategier för att minska återidentifieringsriskerna i beacons. De två första strategierna manipulerar fyren så att närvaron av sällsynta alleler skyms; den tredje strategin budgeterar antalet åtkomster per användare för varje enskilt genom. Med hjälp av en fyr som innehåller data från 1000 Genomes-projektet visar vi att de föreslagna strategierna effektivt kan minska återidentifieringsrisken i beacon-liknande dataset.
Omvänt är Beacon fortfarande utsatt för risk för återidentifiering, eftersom ingen av de tre praktiska strategier som beskrivs i Ref ännu har genomförts.
Addressing Beacon re-identification attacks: quantification and mitigation of privacy risks
{'venue': None, 'journal': 'Journal of the American Medical Informatics Association', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Computer Science']}