Bakgrund: Beräkningsmodeller spelar en allt viktigare roll i bedömningen och kontrollen av folkhälsokriser, vilket visades under 2009 års H1N1-influensapandemi. Mycket forskning har gjorts under de senaste åren i utvecklingen av sofistikerade datadrivna modeller för realistiska datorbaserade simuleringar av smittspridning. För närvarande finns dock endast ett fåtal beräkningsverktyg tillgängliga för att bedöma scenarier, förutsäga epidemisk utveckling och hantera hälsokriser som kan gynna en bred publik av användare, däribland beslutsfattare och hälsoinstitutioner. Resultat: Vi presenterar "GLEaMviz", ett allmänt tillgängligt mjukvarusystem som simulerar spridningen av nya infektionssjukdomar mellan människor över hela världen. Verktyget GLEaMviz består av tre komponenter: klientprogrammet, proxy middleware och simuleringsmotorn. De två senare komponenterna utgör GLEaMviz-servern. Simuleringsmotorn utnyttjar ramverket Global Epidemic and Mobility (GLEaM), ett stokastiskt beräkningssystem som integrerar globalt högupplösta demografiska data och mobilitetsdata för att simulera sjukdomsspridning på global nivå. GLEaMviz design syftar till att maximera flexibiliteten i att definiera sjukdomskategorimodellen och konfigurera simuleringsscenariot; det gör det möjligt för användaren att ställa in en mängd olika parametrar inklusive: fackspecifika funktioner, övergångsvärden, och miljöpåverkan. Utgången är en dynamisk karta och en motsvarande uppsättning diagram som kvantitativt beskriver sjukdomens geo-temporella utveckling. Programvaran är utformad som ett klient-server-system. Den multiplattformsklient, som kan installeras på användarens lokala maskin, används för att ställa in simuleringar som kommer att utföras på servern och därmed undvika särskilda krav för stora beräkningsfunktioner på användarsidan. Slutsatser: Det användarvänliga grafiska gränssnittet för verktyget GLEaMviz, tillsammans med dess höga detaljnivå och realismen i dess inbyggda modelleringsstrategi, öppnar plattformen för att simulera realistiska epidemiska scenarier. Dessa funktioner gör GLEaMviz beräkningsverktyg till ett praktiskt undervisnings- och utbildningsverktyg samt ett första steg mot utvecklingen av ett beräkningsverktyg som syftar till att underlätta användning och utnyttjande av beräkningsmodeller för beslutsfattande och scenarioanalys av utbrott av infektionssjukdomar.
Ett exempel är GLEAMviz REF, ett offentligt tillgängligt system som simulerar realistiska infektionssjukdomar spridda över hela världen.
The GLEaMviz computational tool, a publicly available software to explore realistic epidemic spreading scenarios at the global scale
{'venue': 'BMC Infectious Diseases', 'journal': 'BMC Infectious Diseases', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Geography']}