Motivering: Händelseextrahering med hjälp av uttrycksfulla strukturerade representationer har varit en viktig del av den senaste tidens insatser inom biomedicinsk informationsextrahering. Dock har resurser och metoder för händelseextraktion hittills nästan uteslutande fokuserat på molekylära enheter och processer, vilket begränsar deras tillämplighet. Resultat: Vi utökar händelseextraktionen till biomedicinsk informationsextrahering för att omfatta alla nivåer av biologisk organisation från molekylen till hela organismen. Vi presenterar ontologiska stiftelser, måltyper och riktlinjer för enhets- och händelseanteckningar och introducerar den nya multi-level event-extraheringen (MLEE) corpus, manuellt kommenterad med hjälp av en strukturerad representation för händelseextrahering. Vi anpassar och utvärderar vidare namngivna enhets- och händelseextraheringsmetoder för den nya uppgiften, vilket visar att båda kan uppnås med prestanda i stort sett jämförbar med den för etablerade molekylära enheter och händelseextraheringsuppgifter. Tillgänglighet: De resurser och metoder som införs i denna studie finns tillgängliga på http://nactem.ac.uk/MLEE/.
I multi-nivå händelseextraktion (MLEE) corpus REF, strukturen utvidgas till att omfatta anatomiska enheter och processer inklusive sjukdomsceller och vävnader.
Event extraction across multiple levels of biological organization
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}