Sammanfattning: Protein Structural Interactome Map (PSIMAP) är en global interaktionskarta som beskriver domän-domän- och protein-proteininteraktionsinformation för kända proteindatabankstrukturer. Den beräknar det euklideiska avståndet för att bestämma interaktioner mellan möjliga par av strukturella domäner i proteiner. PSIbase är en databas- och filserver för proteinstrukturell interaktionsinformation beräknad med PSIMAP-algoritmen. PSIbase ger också en lättanvänd proteindomäntilldelningsmodul, interaktionsnavigering och visuella verktyg. Användare kan hämta möjliga interaktionspartners av deras proteiner av intressen om en betydande homologi uppdrag görs med deras frågesekvenser.
PSIbase REF är också en databas som används för att konstruera en interaktionskarta för två proteinstrukturer baserade på PSIMAP-algoritmen.
PSIbase: a database of Protein Structural Interactome map (PSIMAP)
{'venue': 'Bioinformatics', 'journal': 'Bioinformatics', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}