Datadriven upptäckt vid komplexa neurologiska störningar har potential att extrahera meningsfull synergisk kunskap från stora, heterogena datauppsättningar för att öka potentialen för precisionsmedicin. Här beskriver vi tillämpningen av topologisk dataanalys (TDA) för datadriven upptäckt i prekliniska traumatiska hjärnskador (TBI) och ryggmärgsskador (SCI) datauppsättningar minerade från Visualized Syndromic Information and Outcomes for Neurotrauma-SCI (VISION-SCI) arkiv. Genom direkt visualisering av inbördes relaterade histopatologiska, funktionella och hälsomässiga resultat upptäckte TDA nya mönster över hela det syndromiska nätverket, upptäckt interaktioner mellan SCI och samtidig förekomst av TBI, samt skadliga läkemedelseffekter i opublicerade prekliniska multicenterprövningsdata i SCI. TDA visade också att perioperativ hypertension förutspådde långsiktig återhämtning bättre än något testat läkemedel efter bröstkorgen SCI hos råttor. TDA-baserad datadriven upptäckt har stor potential för beslutsstöd för grundforskning och kliniska problem såsom utfallsbedömning, neurokritisk vård, behandlingsplanering och snabb precisionsdiagnos.
Nielson m.fl. REF använder TDA för datadriven upptäckt i prekliniska traumatiska hjärnskador och ryggmärgsskador dataset.
Topological data analysis for discovery in preclinical spinal cord injury and traumatic brain injury
{'venue': 'Nature communications', 'journal': 'Nature communications', 'mag_field_of_study': ['Medicine', 'Biology']}