Berättande information i Electronic Health Records (EHR) och litteraturartiklar innehåller en mängd klinisk information om behandling, diagnos, medicinering och familjehistoria. Detta inkluderar ofta detaljerad fenotyp information för specifika sjukdomar, vilket i sin tur kan bidra till att identifiera riskfaktorer och därmed avgöra känsligheten hos olika patienter. Sådan information kan bidra till att förbättra vårdtillämpningar, inklusive Clinical Decision Support Systems (CDS). Verktyg för klinisk textbrytning (TM) kan ge effektiva automatiserade metoder för att extrahera och integrera viktig information gömd i de stora volymerna av tillgänglig text. Utveckling eller anpassning av TM-verktyg är beroende av tillgången till kommenterad utbildning corpora, även om få sådana corpora finns för den kliniska domänen. Som svar har vi skapat en ny kommenterad corpus (PhenoCHF), med fokus på identifiering av fenotyp information för en specifik klinisk sub-domän, dvs kronisk hjärtsvikt (CHF). Korpus är unikt på detta område, i sin integrering av information från både EHR (300 sammanfattningar) och litteraturartiklar (5 fulltextpapper). I notsystemet, vars utformning vägleddes av en domänexpert, ingår både enheter och förbindelser som är relevanta för CHF. Ytterligare två domänexperter gjorde noteringen, vilket resulterade i högkvalitativ notering, med avtalshastigheter upp till 0,92 F-Score.
En kommenterad corpus (PhenoCHF), fokuserar på identifiering av fenotyp information för en specifik klinisk sub-domän, dvs. kronisk hjärtsvikt (CHF), presenteras i REF.
Building a semantically annotated corpus for congestive heart and renal failure from clinical records and the literature
{'venue': 'Louhi@EACL', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science']}