Syfte. Att utveckla och testa en metod för att automatiskt upptäcka inkonsekvenser mellan förälder och barn är-en relation i Metathesaurus och de förfader-decendent relationer i det semantiska nätverket av det enhetliga medicinska språksystemet (UMLS). Metoder. Vi utnyttjade det faktum att varje Metathesaurus koncept tilldelas en eller flera semantiska typer från UMLS Semantic Network och att de semantiska typerna arrangeras i en hierarki. Vi jämförde de semantiska typerna av varje par av föräldra- och barnbegrepp för att avgöra om typerna ''förklarade'' Metathesaurus är-en relation. Vi betraktade fall där den semantiska typen av förälder varken var densamma som, eller en förfader till, den semantiska typen av barn som "oförklaras". Vi tillämpade denna metod på lanseringen av UMLS i januari 2002 och undersökte de oförklarliga fall vi upptäckte för att fastställa deras orsaker. Resultat. Vi fann att 17,022 (24,3%) av föräldra-barnet är ett förhållande i UMLS Metathesaurus inte kunde förklaras baserat på de semantiska typerna av begreppen. Orsakerna till dessa skillnader var bland annat fall där föräldern eller barnet saknade en semantisk typ, fall där den semantiska typen av barn var för allmän eller den semantiska typen av förälder var för specifik, fall där förhållandet mellan förälder och barn var felaktigt, och fall där ett förfader-decendent förhållande bör läggas till UMLS semantiskt nätverk. I många fall, den specifika orsaken till diskrepansen kan inte lösas utan auktoritativ bedömning av UMLS utvecklare. Slutsatser. Vår metod upptäcker framgångsrikt inkonsekvenser mellan hierarkierna i UMLS Metathesaurus och Semantic Network. Vi anser att vår metod bör läggas till den uppsättning verktyg som UMLS-utvecklarna använder för att underhålla och granska UMLS kunskapskällor.
Detta tillvägagångssätt, som ytterligare undersöktes i REF, var användbart för att upptäcka inte bara felaktiga och saknade uppgifter, utan också fall där de ST(er) av föräldrabegreppet var mer specifika än ST(s) i barnbegreppet.
Consistency across the Hierarchies of the UMLS Semantic Network and Metathesaurus
{'venue': 'Journal of Biomedical Informatics', 'journal': None, 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}