Sammanfattning av denna webbsida: Att bygga matematiska modeller av cellulära nätverk är kärnan i systembiologin. Det omfattar bland annat återuppbyggnad av strukturen av interaktioner mellan molekylära komponenter, som kallas nätverksinferens eller omvänd ingenjörskonst. Informationsteori kan hjälpa till i målet att extrahera så mycket information som möjligt från tillgängliga data. Ett stort antal metoder som bygger på dessa begrepp har föreslagits i litteraturen, inte bara i biologitidskrifter, utan inom ett brett spektrum av områden. Deras kritiska jämförelse är svår på grund av de olika inriktningarna och antagandet av olika terminologier. Här försöker vi se över några av de befintliga teoretiska metoderna för nätverksinferens, och klargöra deras skillnader. Även om vissa av dessa metoder har uppnått anmärkningsvärd framgång återstår många utmaningar, bland vilka vi kan nämna ofullständiga mätningar, bullriga data, kontraintuitivt beteende som uppstår från icke-linjära relationer eller återkopplingsslingor, och beräkningsbördan för att hantera stora datamängder.
Villaverde m.fl. Ref gick igenom några av de befintliga metoderna för informationsteori för att dra slutsatser om nätverk, och klargjorde deras skillnader.
Reverse Engineering Cellular Networks with Information Theoretic Methods
{'venue': 'Cells', 'journal': 'Cells', 'mag_field_of_study': ['Computer Science', 'Medicine']}