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En esa guerra Osorio estuvo siempre al lado de Nariño, que era el presidente de Cundinamarca, y cuando al fin, vencedor éste de sus enemigos, fué nombrado general en jefe de las tropas que en 1813 marcharon contra Sámano al sur, antes de irse, y para contener á los numerosos y decididos partidarios del gobierno español, creó un tribunal de vigilancia y seguridad, al cual atribuyó la facultad de imponer hasta la pena de muerte en caso necesario. OSORIO fué miembro de ese tribunal, que aun llegó a presidir, y en el cual, a pesar de lo odioso de sus funciones, se atrajo con su conducta el aplauso de los patriotas y el respeto de los realistas. Poco después, nombrado auditor de guerra, marchó á alcanzar el Ejército é hizo esa notable campaña. Ese ejército, después de obtener triunfos sorprendentes en Palace, Calibío, Tasines, Juanambú y Ejido de Pasto, se declaró derrotado sin verdadera causa y abandonó á su Jefe y á los que lo habían acompañado á la ciudad con el objeto de proporcionarle víveres. EI Auditor de Guerra, en esa terrible emergencia, cambio la pluma del letrado por el fusil y combatió mientras fué posible con los numerosos indios que perseguían al General y á su escolta.