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Era natural que las íntimas relaciones establecidas entre el Párroco y sus feligreses, á la manera de las de un padre cariñoso con sus hijos, estrechasen mas y mas la confianza entre ellos é hicieran desaparecer algún tanto el carácter reservado y receloso de los indios, carácter engendrado por el servilismo, y se hiciesen comunicativos para revelarle los restos tradicionales de su antigua vida social, conservados al través de las influencias modificadoras del Nuevo Reino de Granada. DUQUESNE recogió con mucho trabajo y artificio los datos necesarios para escribir la historia religiosa de aquellos pueblos, consultando las relaciones de los antiguos cronistas; también para reorganizar la memoria de su lenguaje, casi extinguido entonces, y escribir una gramática del idioma Muisca; y finalmente, para interpretar, según el sistema astronómico de esta nación, las figuras simbólicas del calendario de piedra en el que dejaron los indios consignadas las revoluciones de sus tiempos. DUQUESNE, después de haber sembrado la semilla del Evangelio en estas dos Parroquias, regresó en 1800 á Santafé de Bogotá, por haber sido nombrado por Carlos IV, Rey de España, Canónigo de merced de la iglesia metropolitana de esta ciudad.