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Partió después á desempeñar una comisión patriótica en las provincias de Socorro y Vélez ; y en esta última, como Secretario de Estado, en 1815, sostuvo enérgicamente la autoridad del Gobernador García Toledo. Mas la suerte adversa de las armas en la batalla de Cachirí sometió, al año siguiente, esas comarcas al ejército expedicionario, bajo del cual sufrió el martirio el citado Gobernador, mientras PEREIRA era designado como víctima por su eficaz cooperación en tan luctuosa campaña. Así es que cuando quedó sepultada, al parecer, la República en la ominosa época del terror, el joven caucano que del Sur al Norte la venía sirviendo, había cumplido ya su deber de leal patricio con su talento, con su fortuna y con su brazo. TII En 1816, perseguido PEREIRA en todas direcciones, emprendió un viaje muy peligroso, desandando de Norte a Sur lo que antes había recorrido, y atravesando gran parte del país por líneas frecuentemente desviadas, hasta poder ocultarse (con un hermano suyo y tres proscritos más) entre las ruinas de Cartago-viejo.