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"Regresó, dice el señor José María Vergara y Vergara, á su ciudad natal después de tan larga ausencia, trayendo el certificado de sus feligreses que acreditaba sus costumbres purísimas y su consagración; y además una piedra con geroglíficos, su explicación, una gramática del idioma Muisca, una vasta colección de sermones y una interpretación del antiguo y famoso enigma Elia Lelia Crispis, que durante algunos siglos había sido la desesperación de los sabios anticuarios de Europa." Este ilustre sacerdote fué humilde en demasía, pues sus aspiraciones no pasaron más allá de los límites de la investigación científica en la arqueología chibcha, conservando los resultados que obtuvo en simples manuscritos ; esta verdad es confirmada por la circunstancia de no haberse hallado impreso ninguno de sus trabajos en una época en que ocupaba puesto distinguido en la sociedad, y cuando la imprenta publicaba cosas fútiles y de ningún valor; se limitó únicamente á presentar el resumen de sus manuscritos al señor Mutis, Director de la Expedición Botánica del Virreinato ; éste resumen fue el publicado por el Coronel Acosta, y tiene por título: (3) José María Vergara y Vergara.