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Tan justo como profundo dolor se propagó rápidamente por toda la Diócesis, dejándola sumida en el luto y en las lágrimas. Después de veinticuatro horas de su fallecimiento fué sepultado su cadáver, mitad debajo del altar mayor de la Catedral y mitad fuera, en el presbiterio, a petición del venerable Dean y Cabildo en sede vacante y mandamiento de los señores de la real Audiencia para que fuese depositado allí. El entierro fué de extraordinario concurso y suntuosamente costeado por sus albaceas, y se dieron 1,500 pesos de limosnas. Se sabe también que á pocos días se le hicieron honras en que predicó la oración funebre el Reverendo Padre Fray Luis de Jodar. Durante un año entero ardieron sobre su tumba doce cirios, y se hizo el cabo de año con la pompa correspondiente a la dignidad arzobispal, como en aquellos tiempos. En 6 de Noviembre de 1654 otorgaron su testamento los apoderados del señor Torres por ante el escribano Pedro de Bustamante y los testigos licenciado José de la Barrera, abogado de esta real Audiencia ; Blas Moreno Mejía, Juan Rodríguez Amarillo, D. Diego de Ochoa y Abechucho, solicitador del real Fisco, y Francisco de Salazar.