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En esa época editó las Poesías, acompañadas de un Tratado de métrica, del doctor Manuel María Madiedo, el Diccionario para pensar, colección formada con gran tino y gusto por el mismo PÉREZ, y otras obras de ingenios neogranadinos que no recordamos. Cuando estalló en algunos Estados de la Confederación, el movimiento revolucionario acaudillado por varios prohombres del partido liberal, en 1860, se recrudeció también la lucha periodística, y PÉREZ defendió con ardor, desde las columnas de El Porvenir, sus convicciones políticas y el Gobierno presidido por el probo é ilustrado doctor D. Mariano Ospina. Apenas concedida por las autoridades competentes la organización de un cuerpo de las milicias reunidas de Bogotá, Guasca y Guatavita, solicitada en dicha hoja, tal fuerza fué puesta bajo el mando del mismo PÉREZ. Con este motivo reanudó su carrera militar; se fué á mediados de abril de 1861, con su cuerpo de ejército, que hacía parte de la 7ª División que guarnecía la capital, á engrosar el ejército gobiernista que se hallaba en Facatativá, y dejó encargado de la Redacción de El Porvenir al hábil escritor, señor D. Sergio Arboleda, quien desempeño su cometido cerca de dos meses.