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A la cabeza de su tropa, que constaba de 600 hombres, y con el grado de Coronel, PÉREZ desplegó marcada valentía en la reñidísima , batalla de Subachoque, el 25 de abril, así como en los recios encuentros del mes de Junio. Llego el 18 de julio del mismo año, y los ejércitos contendores se afrontaron en las goteras, y luégo en las calles de la capital para decidir ese día, hasta cierto punto, la suerte de la República. Empezaba el combate de San-Diego, cuando PÉREZ fué herido gravemente : levantaronle de allí casi moribundo, y durante algunos días se temió por su vida. Esta circunstancia le libró entonces de las duras amenazas del Jefe triunfante, General Tomás C. de Mosquera, que ocupó en seguida esta ciudad. La lucha continuó encarnizada en distintos puntos del país con éxito vario para uno y otro bando.