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También fué llevada á cabo en aquellos días la construcción del Observatorio Astronómico, por el cual anhelaba el sabio Mutis. El arquitecto capuchino, Fray Domingo Petrez, puso la primera piedra de este hermoso edificio el 24 de mayo de 1802 y le concluyó el 20 de agosto del año siguiente. Pudo entonces Caldas entregarse á " conquistar las regiones antárticas del Cielo," como el mismo solía decir en su sublime lenguaje. Ya hemos dicho que D. Antonio Amar y Borbón sucedió á Mendinueta en 1803. D. José Gregorio Gutiérrez Moreno regresó de Cartagena hacia la misma época, y en agosto de 1805 se unió en matrimonio a D. Antonia, hija de D. Javier Vergara y de D. Francisca Sanz de Santamaría y Prieto. Dejó entonces el comercio, á que había estado consagrado durante unos pocos años, y se entregó á las faenas agrícolas en una de las haciendas de su padre. Allí se encontraba rodeado de sus labriegos y ocupado en recoger la mies que había hecho brotar de la tierra con el sudor de su frente, cuando a principios del año de 1809 recibió del Cabildo de Santafé el encargo de representar los intereses del pueblo en el delicado destino de Procurador general, en asocio de D. Camilo Torres, que le fué nombrado asesor.