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En la cruenta guerra civil de que fue victima el país de 1860 á 1862, llegó á GUTIÉRREZ VERGARA la más dolorosa y cruel época de su vida ; y por el puesto que ocupaba en el Gobierno que sucumbió, así como por las graves obligaciones que se creyó en el caso de llenar y que dictaron su conocida frase de " Los deberes no se renuncian," fue un martir que arrostro con levantado ánimo y virtud varonil las persecuciones y duras pruebas a que se le sometió, llegando estas hasta el punto de tenerlo en capilla para ser fusilado, en circunstancias en que por una caída había sufrido la ruptura de una pierna, que no sanó jamás por completo, y de la cual cojeaba hasta sus últimos días. Aquella larga y combatida vida, consagrada á la patria, terminó en la mañana del 3 de Noviembre de 1877, y para dar una mejor idea de ella y de los méritos del que nos ocupa, cedemos la palabra al señor D. Rafael Pombo, tomando de la bien escrita necrologia que por aquella época escribió, en El Zipa número 14, lo siguiente que completará la biografía del ilustre ciudadano que, apagada la pasión política, lo coloca la posteridad en notable é importante sitio de la historia patria moderna.