Hvad var Peder Holms karakteristika som forelæser? 


Hans foredrag var uendelig tørt og kedsommeligt, hans stemme frastødende, og vanskeligt var det for ham at have tilhørere, når ikke hensynet til eksamen og håbet om stipendium gjorde sig gældende hos disse. "Man skulde høre mans Kollegier, saa kunde man nok selv hjælpe dem til Stipendier», skal han oftere have ladet sig forlyde med lige over for de studerende. Men i øvrigt er der ikke få blandt hans disciple, som med påskønnelse har erkendt den godhed og redebonne hjælpsomhed, der blev dem til del fra denne grundhæderlige, men snæversynede lærde.
1601 blev byens indbyggere næsten udryddet af pest og i 1645 forårsagede en stormflod ca. 80 menneskers død og 40 skibes undergang.  En negativ virkning havde også uroligheder som opstod i 1666, da lokale oprørte indbyggere i byens havn ødelagde engelske købmænds vintønder lige før udskibningen. 1697 blev byen ramt af en stor brand, som ødelagde over hundrede huse.