La parte superior del escudo se encuentra un yelmo español, el cual representa el paso de Sebastián de Benalcázar por tierras zapotillanas, desde Los Andes bajos hacia la conquista del Reino de Quito. En el contorno del escudo se aprecia el tricolor del Ecuador, significado de la soberanía nacional. Dentro del escudo se pueden observar seis divisiones o cuarteles desde la parte superior izquierda:
- El primer cuartel, el fondo blanco representa la paz y en el centro el Ave Fénix representa el resurgir del pueblo zapotillano tras las guerras, incendios, sequías y terremotos.
- El segundo cuartel con fondo verde en forma de flecha significa el progreso y avance de Zapotillo y las siete estrellas representa las siete parroquias que conforman este cantón.
- El tercer cuartel representa el cielo presente en el territorio y un sol radiante que atraviesa los tres cuarteles.
- El cuarto cuartel se observa tres montañas de diferente color significando: La montaña verde representando la vida de sus bosques y producción agrícola, la montaña naranja son las tierras fértiles que aún no han sido explotadas y la montaña gris son las lutitas (cascajo) que conforman sus suelos.
- El quinto cuartel muestra un río en forma de zeta que representa a Zapotillo y sus fuentes hídricas, un bote en el centro que significa el comercio internacional con el Perú y el turismo, al frente los sembríos de coco, tamarindo y cebolla.
- El sexto cuartel de color rojo, la sangre de héroes derramada en defensa de la soberanía territorial.

El escudo descansa sobre una cinta, en la que se puede leer CANTÓN ZAPOTILLO, con los colores de la bandera del cantón en la que están grabadas los años 1534 y 1980, fechas de su fundación y cantonización respectivamente.
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