Một số nhà bình luận nghĩ gì về việc Darwin thay đổi cách diễn đạt trong cuốn sách của ông?
Thần học tự nhiên không phải là một học thuyết thống nhất, và trong khi một số người như Louis Agassiz phản đối mạnh mẽ các ý tưởng trong cuốn sách, những người khác tìm kiếm một sự hoà giải trong đó tiến hoá được coi là có mục đích.Trong Giáo hội Anh, một số giáo sĩ tự do đã giải thích chọn lọc tự nhiên như một công cụ do Chúa thiết kế, với giáo sĩ Charles Kingsley coi nó là "một quan niệm cao quý về Thần thánh".Trong ấn bản thứ hai của tháng 1 năm 1860, Darwin trích dẫn Kingsley là "một giáo sĩ nổi tiếng", và thêm cụm từ "bởi Đấng Tạo hoá" vào câu kết thúc, từ đó trở đi đọc "cuộc sống, với một số quyền hạn của nó, ban đầu được Đấng Tạo hoá thở thành một vài hình thức hoặc thành một".Trong khi một số nhà bình luận coi đây là một sự nhượng bộ đối với tôn giáo mà Darwin sau này hối tiếc, quan điểm của Darwin vào thời điểm đó là Thiên Chúa tạo ra sự sống thông qua các quy luật tự nhiên, và ngay cả trong phiên bản đầu tiên cũng có một số tài liệu tham khảo về "sự sáng tạo".
Một số nhà bình luận đã coi đây là một sự nhượng bộ đối với tôn giáo mà Darwin sau đó đã hối tiếc.