Jefferson đã từ chối kế hoạch gì khi nói đến sinh viên đại học?
Những người phản đối Jefferson cho rằng lập trường của ông là sự huỷ diệt và sự từ chối của chính phủ đối với Kitô giáo, nhưng đây chỉ là một bức tranh biếm hoạ. Khi thành lập Đại học Virginia, Jefferson đã khuyến khích tất cả các giáo phái riêng biệt có những nhà thuyết giáo của riêng họ, mặc dù có một lệnh cấm hiến pháp đối với Nhà nước ủng hộ chức danh Giáo sư Thần học, phát sinh từ Đạo luật Tự do Tôn giáo Virginia của ông. Một số người cho rằng sự sắp xếp này "hoàn toàn phù hợp với quan điểm của Jefferson về sự tách biệt giữa nhà thờ và nhà nước"; tuy nhiên, những người khác chỉ ra sự ủng hộ của Jefferson đối với một kế hoạch trong đó sinh viên tại Đại học sẽ tham dự thờ cúng tôn giáo mỗi buổi sáng như là bằng chứng cho thấy quan điểm của ông không phù hợp với sự tách biệt nghiêm ngặt. Vẫn còn những học giả khác, chẳng hạn như Mark David Hall, cố gắng tránh né toàn bộ vấn đề bằng cách lập luận rằng luật học Mỹ tập trung quá hẹp vào bức thư của Jefferson này trong khi không tính đến lịch sử có liên quan khác.