Vi khuẩn tiến hoá từ nhóm tiền sử nào?
Tổ tiên của vi khuẩn hiện đại là các vi sinh vật đơn bào là những dạng sống đầu tiên xuất hiện trên Trái đất, khoảng 4 tỷ năm trước. Trong khoảng 3 tỷ năm, hầu hết các sinh vật đều rất nhỏ, và vi khuẩn và vi khuẩn cổ là những dạng sống chiếm ưu thế. Năm 2008, hoá thạch của các vi sinh vật đã được phát hiện và đặt tên là quần xã sinh vật Francevillian. Mặc dù các hoá thạch vi khuẩn tồn tại, chẳng hạn như stromatolites, việc thiếu hình thái đặc biệt của chúng ngăn cản chúng được sử dụng để kiểm tra lịch sử tiến hoá của vi khuẩn, hoặc cho đến nay thời gian xuất xứ của một loài vi khuẩn cụ thể. Tuy nhiên, các trình tự gen có thể được sử dụng để tái tạo lại phát sinh loài vi khuẩn, và các nghiên cứu này chỉ ra rằng vi khuẩn đã chuyển hướng đầu tiên từ dòng dõi vi khuẩn cổ / nhân chuẩn. Vi khuẩn cũng tham gia vào sự phân kỳ tiến hoá lớn thứ hai, của vi khuẩn cổ và sinh vật nhân chuẩn. Ở đây, sinh vật nhân chuẩn là kết quả của sự xâm nhập của vi khuẩn cổ đại vào các hiệp hội nội cộng sinh với tổ tiên của các tế bào nhân chuẩn, bản thân chúng có thể liên quan đến Archaea. Điều này liên quan đến sự nhấn chìm của các tế bào tiền nhân chuẩn của các cộng sinh alphaproteobacterial để tạo thành ty thể hoặc hydrogenosome, vẫn được tìm thấy trong tất cả các Eukarya đã biết (đôi khi ở dạng giảm cao, ví dụ như trong động vật nguyên sinh "amitochondrial" cổ đại). Sau đó, một số sinh vật nhân chuẩn đã chứa ty thể cũng nhấn chìm các sinh vật giống như vi khuẩn xyanobacterial. Điều này dẫn đến sự hình thành lục lạp trong tảo và thực vật. Ngoài ra còn có một số tảo có nguồn gốc từ các sự kiện nội cộng sinh thậm chí sau này. Ở đây, sinh vật nhân chuẩn nhấn chìm một loại tảo nhân chuẩn phát triển thành một loại thạch cao "thế hệ thứ hai". Điều này được gọi là cộng sinh thứ cấp.
Dòng dõi khảo cổ/sinh vật nhân chuẩn