Nasser đã bổ nhiệm ai làm người đứng đầu mới của lực lượng vũ trang Ai Cập?
Ngày 11 tháng 7, Nasser thay thế Amer bằng Mohamed Fawzi làm tổng tư lệnh, trước sự phản đối của những người trung thành với Amer trong quân đội, 600 người trong số đó đã tuần hành trên tổng hành dinh quân đội và yêu cầu Amer phục hồi chức vụ. Sau khi Nasser sa thải 30 người trung thành để đáp trả, Amer và các đồng minh của ông đã nghĩ ra một kế hoạch lật đổ ông vào ngày 27 tháng 8. Nasser được thông báo về các hoạt động của họ và sau nhiều lời mời, ông đã thuyết phục Amer gặp ông tại nhà vào ngày 24 tháng 8. Nasser đối mặt với Amer về âm mưu đảo chính, mà ông từ chối trước khi bị Mohieddin bắt giữ. Amer tự sát vào ngày 14 tháng 9. Mặc dù mối quan hệ chua chát với Amer, Nasser nói về việc mất "người gần gũi nhất với [anh ta]". Sau đó, Nasser bắt đầu một quá trình phi chính trị hoá các lực lượng vũ trang, bắt giữ hàng chục nhân vật quân sự và tình báo hàng đầu trung thành với Amer.
Mohamed Fawzi