Marseille được thành lập vào năm nào?
Nghiên cứu cũng phát hiện ra rằng có hai nhánh chưa biết nhưng có liên quan trước đây (các nhánh di truyền) của bộ gen Y. pestis liên quan đến các ngôi mộ tập thể thời trung cổ. Các nhánh này (được cho là đã tuyệt chủng) được tìm thấy là tổ tiên của các chủng Y. pestis hiện đại Y. p. orientalis và Y. p. medievalis, cho thấy bệnh dịch hạch có thể đã xâm nhập vào châu Âu theo hai làn sóng. Các cuộc khảo sát về hố dịch hạch ở Pháp và Anh cho thấy biến thể đầu tiên xâm nhập vào châu Âu qua cảng Marseille vào khoảng tháng 11 năm 1347 và lan rộng qua Pháp trong hai năm tới, cuối cùng đến Anh vào mùa xuân năm 1349, nơi nó lan rộng khắp đất nước trong ba dịch bệnh. Các cuộc khảo sát về hố dịch hạch vẫn còn từ thị trấn Bergen op Zoom của Hà Lan cho thấy kiểu gen Y. pestis chịu trách nhiệm về đại dịch lây lan qua các quốc gia thấp từ 1350 khác với ở Anh và Pháp, ngụ ý Bergen op Zoom (và có thể các phần khác của miền nam Hà Lan) không bị nhiễm trực tiếp từ Anh hoặc Pháp vào năm 1349 và cho thấy một làn sóng dịch hạch thứ hai, khác với ở Anh và Pháp, có thể đã được chuyển đến các quốc gia thấp từ Na Uy, các thành phố Hanseatic hoặc một địa điểm khác.