Diagnosis of amebiasis is supported by finding amebic trophozoites, cysts, or both in stool or tissues; however, pathogenic E histolytica are morphologically indistinguishable from nonpathogenic E dispar, as well as E moshkovskii and E bangladeshi, which are of uncertain pathogenicity.
Chẩn đoán bệnh do amip cần được xác định bằng cách tìm amip thể tự dưỡng, bào nang amip, hoặc cả hai trong phân hay mô tổn thương: tuy nhiên E. histolytica rất khó phân biệt về hình thái E. dispar với các căn nguyên amip không gây bệnh khác là E. moshkovskii và E. bangladeshi.