A number of different gene mutations can cause the phenotype, including mutations of some of the genes that are involved with syndromic oral clefts, which suggests there is significant overlap between syndromic and nonsyndromic clefts.
Một số đột biến gen khác nhau có thể gây ra kiểu hình, bao gồm đột biến của một số gen có liên quan đến các khe ở miệng hội chứng, cho thấy có sự chồng chéo đáng kể giữa các khe có hội chứng và không hội chứng.