Patients with the X-linked form or CD40 mutations are given prophylactic trimethoprim / sulfamethoxazole to prevent P jirovecii infection, and environmental precautions are taken to reduce the risk of Cryptosporidium infection (see Gastroenteritis: prevention).
Bệnh nhân có đột biến dạng có liên kết X hoặc đột biến CD40 được cho dùng trimethopri m/s ulfamethoxazole để ngăn ngừa P. jirovecii và các biện pháp phòng ngừa về môi trường được thực hiện để làm giảm nguy cơ bị nhiễm Cryptosporidium (xem Viêm đường tiêu hoá: phòng ngừa).