Obligate anaerobes are major components of the normal microflora on mucous membranes, especially of the oral cavity (gingival, odontogenic, and pharyngeal), lower gastrointestinal (GI) tract, and vagina; these anaerobes cause disease when normal mucosal barriers break down.
Vi khuẩn kỵ khí bắt buộc là thành phần chính của hệ vi sinh vật bình thường trên các màng nhày niêm mạc, đặc biệt là miệng, đường tiêu hoá dưới và âm đạo; các vi khuẩn kỵ khí này gây bệnh khi hàng rào niêm mạc bình thường bị phá vỡ.