Some autoimmune disorders are linked to specific HLA alleles—for example, Ankylosing spondylitis and reactive arthritis to HLA-B27 Multiple sclerosis to HLA-DR2 Narcolepsy to HLA-DR2 and HLA-DQB1 * 06: 02 Psoriasis to HLA-C * 06: 02 Rheumatoid arthritis to HLA-DR4 Type 1 diabetes mellitus to HLA-DQ2 and HLA-DQ8
Một số rối loạn tự miễn dịch có liên quan đến các allel HLA cụ thể, ví dụ, Viêm cột sống dính khớp và viêm khớp phản ứng đến HLA-B 27 Đa xơ cứng đến HLA-DR 2 Chứng ngủ rũ đến HLA-DR 2 và HLA-DQB 1 * 06:02 Bệnh vẩy nến đến HLA-C * 06:02 Viêm khớp dạng thấp đến HLA-DR 4 Đái tháo đường type 1 đến HLA-DQ 2 và HLA-DQ 8