Die Haupteinschränkung ist, dass sich der Qo-Wert in aller Regel auf die Muttersubstanz bezieht, so dass der Qo-Wert bei Arzneimitteln mit aktiven Metaboliten (z. B. Glibenclamid, Pethidin) im Hinblick auf eine Dosisanpassung nicht aussagekräftig ist.