Министерстве Марий Эл Республикын сомылшуктызо кучемжын моло органже, сомылшуктызо кучемын федерал органже-влакын верласе органышт, верысе шкевиктем орган, мер ушем да моло организаций-влак дене кылым куча.
Министерство осуществляет взаимодействие с другими органами исполнительной власти Республики Марий Эл, территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, органами местного самоуправления, общественными объединениями и иными организациями.