<s> from pysb import * <EOL> from pysb . macros import * <EOL> site_name = '<STR_LIT:b>' <EOL> def catalyze_b ( enz , sub , product , klist ) : <EOL> """<STR_LIT>""" <EOL> return catalyze ( enz , site_name , sub , site_name , product , klist ) <EOL> def bind_table_b ( table ) : <EOL> """<STR_LIT>""" <EOL> return bind_table ( table , site_name , site_name ) <EOL> KF = <NUM_LIT> <EOL> KR = <NUM_LIT> <EOL> KC = <NUM_LIT:1> <EOL> bid_rates = [ <NUM_LIT> , <NUM_LIT> , <NUM_LIT:1> ] <EOL> bcl2_rates = [ <NUM_LIT> , <NUM_LIT> ] <EOL> Model ( ) <EOL> Monomer ( '<STR_LIT>' , [ '<STR_LIT:b>' ] ) <EOL> Monomer ( '<STR_LIT>' , [ '<STR_LIT:b>' , '<STR_LIT:S>' ] , { '<STR_LIT:S>' : [ '<STR_LIT:u>' , '<STR_LIT:t>' , '<STR_LIT:m>' ] } ) <EOL> Monomer ( '<STR_LIT>' , [ '<STR_LIT:b>' , '<STR_LIT:S>' ] , { '<STR_LIT:S>' : [ '<STR_LIT:i>' , '<STR_LIT:a>' , '<STR_LIT:m>' ] } ) <EOL> Monomer ( '<STR_LIT>' , [ '<STR_LIT:b>' , '<STR_LIT:S>' ] , { '<STR_LIT:S>' : [ '<STR_LIT:i>' , '<STR_LIT:a>' ] } ) <EOL> Monomer ( '<STR_LIT>' , [ '<STR_LIT:b>' , '<STR_LIT:S>' ] , { '<STR_LIT:S>' : [ '<STR_LIT:c>' , '<STR_LIT:m>' ] } ) <EOL> Monomer ( '<STR_LIT>' , [ '<STR_LIT:b>' ] ) <EOL> Monomer ( '<STR_LIT>' , [ '<STR_LIT:b>' ] ) <EOL> catalyze_b ( C8 , Bid ( S = '<STR_LIT:u>' ) , Bid ( S = '<STR_LIT:t>' ) , [ KF , KR , KC ] ) <EOL> catalyze_b ( Bid ( S = '<STR_LIT:m>' ) , Bax ( S = '<STR_LIT:i>' ) , Bax ( S = '<STR_LIT:m>' ) , bid_rates ) <EOL> catalyze_b ( Bid ( S = '<STR_LIT:m>' ) , Bak ( S = '<STR_LIT:i>' ) , Bak ( S = '<STR_LIT:a>' ) , bid_rates ) <EOL> equilibrate ( Bid ( b = None , S = '<STR_LIT:t>' ) , Bid ( b = None , S = '<STR_LIT:m>' ) , [ <NUM_LIT> , <NUM_LIT> ] ) <EOL> equilibrate ( Bax ( b = None , S = '<STR_LIT:m>' ) , Bax ( b = None , S = '<STR_LIT:a>' ) , [ <NUM_LIT> , <NUM_LIT> ] ) <EOL> equilibrate ( BclxL ( b = None , S = '<STR_LIT:c>' ) , BclxL ( b = None , S = '<STR_LIT:m>' ) , [ <NUM_LIT> , <NUM_LIT> ] ) <EOL> bind_table_b ( [ [ Bcl2 , BclxL ( S = '<STR_LIT:m>' ) , Mcl1 ] , <EOL> [ Bid ( S = '<STR_LIT:m>' ) , bcl2_rates , bcl2_rates , bcl2_rates ] , <EOL> [ Bax ( S = '<STR_LIT:a>' ) , bcl2_rates , bcl2_rates , None ] , <EOL> [ Bak ( S = '<STR_LIT:a>' ) , None , bcl2_rates , bcl2_rates ] ] ) <EOL> Parameter ( '<STR_LIT>' , <NUM_LIT> ) <EOL> Parameter ( '<STR_LIT>' , <NUM_LIT> ) <EOL> Parameter ( '<STR_LIT>' , <NUM_LIT> ) <EOL> Parameter ( '<STR_LIT>' , <NUM_LIT> ) <EOL> Parameter ( '<STR_LIT>' , <NUM_LIT> ) <EOL> Parameter ( '<STR_LIT>' , <NUM_LIT> ) <EOL> Parameter ( '<STR_LIT>' , <NUM_LIT> ) <EOL> Initial ( C8 ( b = None ) , C8_0 ) <EOL> Initial ( Bid ( b = None , S = '<STR_LIT:u>' ) , Bid_0 ) <EOL> Initial ( Bax ( b = None , S = '<STR_LIT:i>' ) , Bax_0 ) <EOL> Initial ( Bak ( b = None , S = '<STR_LIT:i>' ) , Bak_0 ) <EOL> Initial ( BclxL ( b = None , S = '<STR_LIT:c>' ) , BclxL_0 ) <EOL> Initial ( Bcl2 ( b = None ) , Bcl2_0 ) <EOL> Initial ( Mcl1 ( b = None ) , Mcl1_0 ) <EOL> Observable ( '<STR_LIT>' , Bid ( b = None , S = '<STR_LIT:m>' ) ) <EOL> Observable ( '<STR_LIT>' , Bax ( b = None , S = '<STR_LIT:a>' ) ) <EOL> Observable ( '<STR_LIT>' , Bax ( b = None , S = '<STR_LIT:a>' ) ) <EOL> Observable ( '<STR_LIT>' , Bax ( b = <NUM_LIT:1> , S = '<STR_LIT:a>' ) % BclxL ( b = <NUM_LIT:1> , S = '<STR_LIT:m>' ) ) </s>
